STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS 231-X10 FAJININ KISMİ GENOMİK KARAKTERİZASYONU
Authors : Esra Acar-Soykut
Pages : 136-144
View : 8 | Download : 2
Publication Date : 2017-04-15
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışmada, daha önce yapılmış çalışmalarla morfolojik olarak tanımlanmış, konakçı spektrumu ve yapısal proteinleri belirlenmiş, restriksiyon fragment analizleri yapılmış 231-X10 fajının belirli bir genom bölgesinin dizi analizi yapılmıştır. Dizi analizi yapılmış olan bu bölgede 13 adet açık okuma çerçevesinin yani 13 farklı fonksiyonu kodlayan gen bölgesinin olabileceği ortaya çıkarılmıştır. Bu gen bölgelerinin faj DNA’sının replikasyonu, DNA’nın paketlenmesi, kapsid ve kuyruk yapısının oluşumundan sorumlu proteinleri kodladığı belirlenmiştir. 231-X10 fajına ait bu genom bölgesi tarafından kodlanan proteinlerin aminoasit bazında cos-tipi DNA paketleme mekanizmasına sahip fajlarla yüksek benzerlik gösterdiği tespit edilmiş ve dolayısıyla bu fajın da cos-tipi olabileceği sonucuna varılmıştır. Yapılan bu incelemeler sonucunda S. thermophilus fajlarının ortak bir atadan geldiği, nokta mutasyonlar, küçük eklemeler ve kayıplar ile evrimleştikleri düşüncesi desteklenmiştir.Keywords : S. thermophilus fajı, dizi analizi, genomik organizasyon