Mikobakteri Türlerinin İdentifikasyonunda Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Parça Uzunluk Polimorfizmi Tekniği ile Klasik Yöntemler Arasındaki Uyumun Belirlenmesi

Authors : Gül Bayram, Gürol Emekdaş

Pages : 8-13

View : 18 | Download : 6

Publication Date : 2008-09-01

Article Type : Research

Abstract :Amaç: Günümüzde tüberkülozun laboratuvar tanısında ve identifikasyonunda karşılaşılan çeşitli zorluklar mevcuttur. Bu çalışmada mikobakteri identifikasyonunda klasik biyokimyasal yöntemler ile moleküler yöntemler arasındaki uyumun belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Biyokimyasal identifikasyonda, nitrat, katalaz ve niasin testleri, moleküler biyolojik teknik olarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Parça Uzunluk Polimorfizmi yöntemi kullanılarak, Mycobacterium spp. olarak izole edilen mikobakterilerin identifikasyonu yapılmıştır. Bulgular: Örneklerin ekim öncesi yapılan Ehrlich Ziehl Neelsen direkt incelemelerinde aside dirençli basil örneklerin 30'unda (%30) saptanmıştır. Örneklerin 43\'ü (%43) kültür yöntemi ile pozitif bulunurken, Ehrlich Ziehl Neelsen ve kültürün aynı anda 30'u (%30) pozitif olarak belirlenmiştir. Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Parça Uzunluk Polimorfizmi yöntemi ile Mycobacterium spp. olarak izole edilen 7 izolatın (%16.3) Nontüberküloz Mikobakteriler olduğu geri kalan 36 (%83.7) örneğin Mycobacterium tuberculosis complex olduğu tespit edildi. Klasik identifikasyon sonucunda 40 suşun katalaz testi düşük, 41 suşun nitratı pozitif bulunurken, 30 suşun niasin testi pozitif bulundu. Sonuç: Bu çalışmada biyokimyasal identifikasyonun moleküler yöntemle uyumu kapa istatistiği ile değerlendirildi. Bu iki yöntem arasındaki uyum orta derecede çıkmıştır. Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Parça Uzunluk Polimorfizmi yönteminin en önemli dezavantajı zaman zaman yanlış pozitif ve negatif sonuçların ortaya çıkabilmesidir. Bu nedenle tüberkülozun laboratuvar tanısında klasik ve moleküler yöntemlerin sonuçları değerlendirilirken mutlaka klinik ön tanı ile birlikte değerlendirilmesi gerektiği düşüncesindeyiz.
Keywords : Mycobacterium tuberculosis complex, Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Parça Uzunluk Polimorfizmi tekniği, identifikasyon