Distinguishing the Protected Designation of Origin Apricot (Prunus armeniaca L. cv. Şalak) from Closely Related Cultivars by High Resolution Melting

Authors : Kaan Hürkan

Pages : 136-142

Doi:10.31594/commagene.891932

View : 19 | Download : 9

Publication Date : 2021-12-31

Article Type : Research

Abstract :Şalak kayısı çeşidi (Prunus armeniaca cv. Şalak) Aras Havzası’nda üretimi yapılan ve coğrafi işarete sahip bir kayısı çeşididir. Tescilli ismi Iğdır Kayısısı olarak belirlenmiştir. Özellikle gıda aldatmacasına maruz kalma potansiyeli olan özel gıda ürünlerinin DNA temelli yöntemler ile tanımlanması güvenilir ve görece ucuz maliyetlidir. Bu çalışmanın amacı Şalak kayısı çeşidinin, yakın ilişkili kayısı çeşitlerden Yüksek Çözünürlüklü Erime (HRM) yöntemi kullanarak ayırt edilmesi için bir protokol geliştirmektir. Çalışmada, daha önceden Prunus türleri için doğrulanmış 12 adet SSR belirtecinin, Türkiye’de üretimi yapılan Şalak (AS), Hasanbey (HB), Hacıhaliloğlu (HH), Kabaaşı (KB) ve Şekerpare (SK) kayısı çeşitlerini ayırt etme başarısı test edilmiştir. Çalışmada ayrıca HRM verilerinden Temel Bileşenler Analizi yapılabilmesi için R yazılımında kullanılabilecek bir komut dosyası oluşturulmuştur. Kılcal elektroforez ile doğrulanmış 12 SSR belirtecinden 11 tanesinin, her kayısı çeşidi için farklı fragmentler çoğalttığı tespit edilmiştir. Temel Bileşenler Analizi ile desteklenmiş HRM sonuçlarının Şalak kayısı çeşidini diğer çeşitlerden başarılı bir şekilde ayırt ettiği belirlenmiştir.
Keywords : Genotipleme, mikrosatelitler, genetik doğrulama, gıda aldatmacası, SSR-HRM