Awa Sppi Nehri’nden (Süleymaniye-Irak) İzole Edilen Acidithiobacillus Cinsi Bakterilerin Ektraselüler Hidrolitik Enzim Üretme Kabiliyetlerinin Belirlenmesi ve 16S rDNA Analizi

Authors : Kerem Özdemir, Ghalib Abdalla Sharef, Metin Ertaş

Pages : 17-20

Doi:10.31594/commagene.392847

View : 28 | Download : 19

Publication Date : 2018-06-30

Article Type : Research

Abstract :Bu araştırmada, Kuzey Irak'ın Süleymaniye şehrinde bulunan Awasppi nehrinden ve Sangaw'daki Darzilais sülfür kaynaklı mağaradan alınan su ve çamur örneklerinden izole edilen Acidithiobacillus bakterilerinin bazı hidrolitik ektraselüler enzim aktiviteleri incelenerek, 16S rDNA gen bölgelerinin sekans analizi temeline dayalı filogenetik pozisyonları belirlenmiştir. İzolatların katalaz aktivitesi pozitif iken, lipaz, proteaz, ksilanaz ve amilaz aktivitesi negatif olarak belirlenmiştir. İzolatların Genomik DNA’ları izole edilerek 16S rDNA gen bölgesi PZR amplifikasyonu ile gerçekleştirilmiştir. Türler arasındaki uzaklığı belirlemek için Maximum Likelihood algoritması kullanılarak oluşturulan filogenetik ağaç NCBI’dan elde edilmiş Acidithiobacillus türlerine ait gen dizileri ve çalışmamızda kullandığımız 2 izolat güçlü bir homoloji ile kümelendiği gözlemlenerek genetik pozisyonları ortaya konmuştur. Karşılaştırmalı 16S rDNA gen dizisi analizi sonucunda, G1 izolatının Acidithiobacillus thiooxidan s’a % 99 benzerlik gösterdiği ve G2 izolatının Acidithiobacillus ferrooxidans ’a % 99 benzerlik gösterdiği belirlenmiştir
Keywords : Acidithiobacillus, Süleymaniye, Enzim, 16S rDNA