ANTIBIOTIC RESISTANCE AND INTEGRON GENE CASSETTES IN ACINETOBACTER BAUMANNII ISOLATES PRODUCED IN LOWER RESPIRATORY TRACT SAMPLES TAKEN FROM THE INTENSIVE CARE UNIT

Authors : Uğur Kostakoğlu, Ayşe Ertürk, Ilknur Esen Yildiz, Songül Özyurt, Ayşegül Çopur Çiçek, Mevlüt Karataş, Emine Sönmez

Pages : 450-460

Doi:10.24938/kutfd.789547

View : 26 | Download : 9

Publication Date : 2020-12-31

Article Type : Research

Abstract :Amaç: Antibiyotik direnç genlerinin bakteriler arasındaki yayılımı, enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde ciddi sorunlara yol açmaktadır. Son zamanlarda bu direnç genlerin integronlarda da bulunduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada alt solunum yollarından alınan kültürlerde üretilen infeksiyon etkeni olan Acinetobacter baumannii suşlarında sınıf 1, sınıf 2 integron varlığı ve antibiyotik direnç genleri araştırıldı.  Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya, Mart 2014- Mart 2015 tarihleri arasında alt solunum yolu örneklerinden izole edilen toplam 86 A. baumannii suşu dahil edildi. İzolatların tanımlanması ve antibiyogramları konvansiyonel metodlar ve Vitek 2 Compact sistemleriyle yapıldı. Suşlarda integron varlığı, sınıf 1 (intI1) ve sınıf 2 (intI2) integraz bölgeleri için özgül primer çiftleri kullanılarak PCR yöntemiyle araştırıldı. İntegron amplifikasyonunun gerçekleştirildiği tüm örnekler hem klonlanarak hem de PCR ürünü olarak DNA dizi analizine tabi tutuldu. Direnç genleri polimeraz zincir reaksiyonu ile tarandı.  Bulgular: İzolatlar trakeal aspiratlar (%33.7), bronkoalveoler lavaj (%29,1), balgam (%22.1), bronşiyal yıkama sıvısı / bronşiyal fırçalama (%4.7), transbronşiyal biyopsi (%4.7), plevral sıvı (%3.4) ve akciğer aspirasyonları / apse (%2.3) örneklerinden elde edildi. Tüm izolatlarda imipenem, meropenem, seftazidim, piperasillin-tazobaktam, ampisilin-sulbaktama karşı direnç saptanırken, siprofloksasin, levofloksasin, gentamisin, amikasin ve tigesikline karşı direnç sırasıyla %97.7, %93.0, %60.5, %53.5 ve %9.3 olarak tespit edildi. Kolistin, tüm suşlara karşı tek etkin antibiyotikti. Integraz I ve II gen pozitiflik oranı sırasıyla %45.4 ve %9.3 iken, sınıf 1 ve 2 integron pozitiflik oranı tüm izolatlarda sırasıyla %31.4 ve %8.1 olarak bulundu. blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaOXA23, blaOXA40, blaOXA58 sırasıyla %70.9, %2.3, %4.7, %7.0, %95.3, %5.8 ve %3.5 bulundu. Sonuç: A . baumannii infeksiyonlarında çoklu ilaç direnci olan suşların ve integron direnç genlerinin birlikte artışı, antibiyotik tedavi stratejilerinin başarısızlığına yol açacaktır.
Keywords : Acinetobacter baumannii, Antibiyotik direnç genleri, alt solunum yolu örnekleri, integron