Homojen Glioblastoma Örneklerinin Yüksek Çözünürlüklü Genetik Teknolojiler ile Analizi

Authors : Mehmet Baysan

Pages : 63-71

Doi:10.21541/apjes.403727

View : 31 | Download : 22

Publication Date : 2018-08-03

Article Type : Research

Abstract :Tümör içi genomik heterojenlik kanserlerde sıkça karşılaşılan bir durumdur. Normal şartlarda her bir hücrede her bir genin iki kopyası vardır ve bazı istisnalar dışında organizmanın farklı hücreleri aynı DNA dizisini taşır. Kanser hücrelerinde ise gerek mutasyonlar sonucu gerekse de DNA silinmeleri ve eklenmeleri sonucu bu düzenli yapı karmaşık ve heterojen bir yapıya dönüşür. Bu genetik heterojenliğin sebebi ve tümör oluşumundaki rolü, genetik veri üretebilme teknolojilerindeki gelişmeler ışığında son zamanlarda çokça çalışılan önemli bir problemdir. Aynı tümörden elde edilmiş yüksek çözünürlüklü homojen numuneler, heterojenliği anlamak için yapılan çalışmalarda büyük önem arz etmektedir. Gerek kanser dokusuna erişimdeki zorluklar, gerekse de finansal limitler böyle yüksek çözünürlüklü veri setlerinin elde edilmesi önünde engel oluşturmaktadır. Glioblastoma multiforme teşhis sonrası ortalama yaşam süresi yaklaşık on beş ay olan, en sık görülen ve en agresif beyin tümörüdür. Bu çalışmada bir glioblastoma hastasından alınan detaylı homojen ve heterojen numuneler kullanılarak elde edilmiş yüksek çözünürlüklü bir veri seti incelenip, yapılan analizler sunulacaktır.
Keywords : Kanser, Bioinformatik, Glioblastoma, DNA Dizileme, DNA Kopya Sayısı