Pulsed-Field Jel Elektroforez (PFGE) Metodu ve Akuatik Organizmalarda Kullanımı

Authors : Mustafa Türe, Ilhan Altinok

Pages : 44-54

View : 30 | Download : 13

Publication Date : 2013-01-04

Article Type : Other

Abstract :PFGE (Pulsed-Field Jel Electroforez), akuakültürde salgın hastalıklara yol açan izolatların ilişkilendirilmelerinde anahtar rol oynayan bir metottur. Teknik, 10 megabaz çifti (Mbç) kadar geniş molekül ağırlığına sahip DNA parçalarının etkin bir biçimde ayrışmasına olanak sağlamıştır. PFGE, çeşitli patojenlerin epidemiyolojisi, genom büyüklüklerinin belirlenmesi, bakteri kromozomlarının fiziksel ve genetik haritalandırılmalarının gerçekleştirilmesi gibi konularda son yıllarda sıkça kullanılan ve altın standart olarak kabul gören bir metottur. Agaroz içerisindeki bakteri hücresinden elde edilen genomik DNA’nın, uygun enzim ile kesimi sonucu oluşan bant desenlerinin yorumlanması şeklinde gerçekleştirilir. Bu derlemede, PFGE’nin genel özellikleri, çalışma prensibi, tipleri, genel ve akuakültürdeki kullanımından söz edilmiştir.
Keywords : Akuakültür, Epidemiyoloji, PFGE, Kesici enzimler