Türkiye’de Yetiştirilen Bazı Sığır Irklarında Akirin 2 Gen Polimorfizminin PCR-RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi

Authors : Güray Coşkun, Bilal Akyüz

Pages : 123-127

View : 12 | Download : 6

Publication Date : 2016-12-20

Article Type : Research

Abstract :Bu çalışmada Türkiye’de yetiştirilen Simental (n=75), İsviçre Esmeri (n=75), Holstein (n=100), Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK) (n=40) ve Boz Irk (n=40) sığırlarında Akirin 2 geninde bulunan c.*188G>A tek nokta polimorfizminin (SNP) belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu çalışmada, c.*188G>A polimorfizmi yönünden genotipleme için polimeraz zincir reaksiyonunu takiben yapılan restriksiyon parçacık büyüklük polimorfizimi (PCR-RFLP) yöntemi kullanılmıştır. Akirin 2 genindeki hedef bölge, PCR ile çoğaltıldıktan sonra elde edilen PCR ürünleri FoK I endonükleaz enzimi ile kesilmiştir. Çalışmada c.*188G>A tek nokta polimorfizmi için A ve G olarak adlandırılan iki allel belirlenmiştir. En yüksek A allel frekansı Simental ırkında (0.27), en yüksek G allel frekansının ise DAK ırkında (0.93) olduğu görülmüştür. Ayrıca, en yüksek AA ve AG frekansı Simental ırkında (0.07 ve 0.39), en yüksek GG genotip frekansı ise DAK ırkında (0.85) belirlenmiştir. Yapılan Ki-kare analiz sonuçlarına göre incelenen beş ırkında c.*188G>A polimorfizmi yönünden Harrdy-Weinberd dengesinde (HWE) oldukları gözlenmiştir. Bu çalışma Türkiye’de yetiştirilen Simental, İsviçre Esmeri, Holstein, DAK ve Boz Irk sığırlarında Akirin 2 geninden bulunan c.*188G>A polimorfizmi yönünden genotiplendirilmelerinin yapıldığı ilk çalışmadır. Sonuç olarak, Türkiye’de yetiştirilen yerli ve Avrupa orijinli sığır ırklarında mermerleşme skoru gibi et kalite özelliklerinin iyileştirilmesinde Akirin 2 genindeki c.*188G>A polimorfizminin kullanılabileceği düşünülmektedir.
Keywords : Akirin 2, Genetik Belirteç, RFLP, Sığır