Atatürk Baraj Gölü’nde (Türkiye) Yaşayan Carassius gibelio (Bloch, 1782) türünün mtDNA COI ve cyt b Analizi

Authors : Arif Parmaksiz, Aynur Demir

Pages : 45-50

Doi:10.26650/tjbc.1112782

View : 29 | Download : 12

Publication Date : 2022-09-09

Article Type : Research

Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı, Atatürk Baraj Gölü’nde yaşayan C. gibelio türünün mtDNA COI ve Cyt b gen bölgelerine ait sekanslara dayalı olarak gen bankasındaki sekanslarla karşılaştırılması ve filogenetik analizlerin yapılmasıdır. Materyal ve Yöntem: Atatürk Baraj Gölü Bozova bölgesinde yaşayan hedef türe ait bireyler balıkçılardan rastgele seçilerek satın alınmıştır. Total DNA izolasyonu, GeneJET Genomic DNA Purification Kit (Thermo Scientific) kullanılarak kas dokusundan protokol talimatları doğrultusunda yapılmıştır. Daha sonra mtDNA COI ve Cyt-b bölgelerine ait özgül primerler kullanılarak ilgili bölgeler PCR yöntemi ile çoğaltılmıştır. Elde edilen PCR ürünleri Agaroz jelde yürütülmüş ve ürün oluşturan örnekler seçilerek hizmet alımı şeklinde ticari firmaya gönderilmiş ve 3500 XL Genetic Analyzer cihazı ile dizi analizi yaptırılmıştır. Bulgular: mtDNA COI ve cyt b gen bölgeleri için sırayla 620 ve 580 bp uzunlukta sekanslar elde edilmiştir. mtDNA COI bölgesi için daha önce Türkiye’de yaşayan bireylerle aynı haplotipler tespit edilmesine rağmen mtDNA Cyt b gen bölgesi için daha önce tanımlanmayan yeni bir haplotip tespit edilmiştir. Sonuç: Atatürk Baraj Gölü’nde yaşayan C. gibelio türüne ait bireylerin mtDNA COI ve Cyt b gen bölgelerine ait sekans analizleri ilk defa bu çalışmada yapılmış ve gen bankasındaki verilerle karşılaştırılmıştır.
Keywords : Atatürk Baraj Gölü, Carassius gibelio, mtDNA, COI, cyt b