Comparison of real-time PCR and conventional cultural methods to detect Escherichia coli O157:H7 in spices in Turkey

Authors : Asli Ozkizilcik, Mustafa Ates, Burcu Cerci

Pages : 113-120

View : 17 | Download : 7

Publication Date : 2012-12-25

Article Type : Other

Abstract :Bu çalışmada, baharatlarda E. coli O157:H7’nin belirlenmesinde Real-Time PCR ve kültürel yöntemlerinin karşılaştırılması için 66 farklı baharat örneği analiz edilmiştir. Bunun için 66 farklı baharat örneği (ham madde) İzmir’in çeşitli yerlerinden temin edilmiştir. Örneklerdeki toplam mikrobiyal yükün belirlenmesi için E. coli O157:H7 yanında toplam aerobik mezofilik bakteri, koliform, fekal koliform sayımları yapılmıştır ve Salmonella sp. varlığına bakılmıştır. Bütün örneklerde ortalama değerler aerobik mezofilik bakteri sayımı 5.1x103 -2.0x108 CFU/g ve koliform sayımı 8.0 x 102 CFU/g olarak bulunmuştur. Hiçbir örnekte Salmonella sp. bulunmamıştır. Kültürel yöntemle bütün örnekler E. coli O157:H7 bakımından negatif bulunurken Real-Time PCR yöntemiyle 4 tane örnek pozitif bulunmuştur. Bu çalışmada RealTime PCR yönteminin kültürel yönteme göre daha güvenilir olduğu gözlenmiştir. Bunun yanında kültürel yöntemle sonuç 4 günde alınırken Real-Time PCR yöntemiyle sadece 20 saatte sonuç alınmıştır
Keywords : Kültürel yöntem, E. coli O157:H7, real-time PCR, baharat