MOLECULAR BASIS AND INTEGRATIVE ANALYSIS OF Rv1463 AS PROBABLE CONSERVED ATP-BINDING PROTEIN BY COMPUTATIONAL APPROACH

Authors : Md Amjad Beg, Mustafa Sevindik, Shahid Haider, Preeti Soni, Priya Bhatia, Shahzul Hasan, Richa Yadav, Fareeda Athar

Pages : 212-226

Doi:10.33483/jfpau.866876

View : 32 | Download : 9

Publication Date : 2021-05-31

Article Type : Research

Abstract :Amaç: Tüberküloz, patojeni olan Mycobacterium tuberculosis H37Rv'nin (M. tuberculosis) şiddetle değişen dinamiği nedeniyle yıllardan beri küresel bir salgın olmuştur. Bu patojenin durumu daha da kötüleşmektedir ve üstesinden gelmek zorlaşmaktadır. Bu yazıda, metal iyonunun plazma membranları boyunca taşınmasına yardımcı olan ve sonuçta bir elektrokimyasal gradyan oluşturan Mycobacterium tuberculosis H37Rv'nin (M. tuberculosis) ATP bağlayıcı proteini için hesaplama yaklaşımlarını kullandı. Rv1463, ATP bağlama motifi (WalkerA) (GXXXXGKS / T) ve (Walkera) (DEXXXXXD) içeren varsayımsal bir protein ve bu motiflerin ATP bağlama ve hidrolizleme aktivitelerindeki önemi üzerinde duruldu. ATP bağlanma özelliğini, transkripsiyonel düzenleyici protein ile etkileşime girerek ve etkileşimli bileşikler magnezyum (Mg) ve Adenosin di fosfat (ADP) ile gösterir. Gereç ve Yöntem: Rv1463'ün yapısı SwissModel web sunucusu tarafından oluşturuldu ve AutoDock kullanılarak moleküler yerleştirme yapıldı. Sonuç ve Tartışma: Mutasyonel analizde, D175 kalıntılarının protein yapısını değiştirebilecek tüm etkileşimlerde ortak olduğunu doğrulandı. Bu hesaplama yaklaşımları, bu hastalığın tedavisinde yeni stratejiler geliştirmede yardımcı olabilir.
Keywords : Moleküler kenetlenme, Mycobacterium tuberculosis, rv1463, tüberküloz