Analysis of IGF1 C472T and TG C422T polymorphisms in Turkish Grey Steppe and Holstein Crossbred Bulls

Authors : Sena Ardicli

Pages : 21-28

Doi:10.30782/uluvfd.392081

View : 14 | Download : 8

Publication Date : 2018-03-05

Article Type : Research

Abstract :Bu çalışmanın amacı, Boz ırkı ve Holstein melezi erkek sığırlarda insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genlerine ait genotipik dağılımın belirlenmesidir. Çalışmada, akraba olmayan 30 baş Boz ırk ve 26 baş Holstein melez sığır kullanılmıştır. Genomik DNA izolasyonu tam kandan standart fenol-kloroform yöntemi ile yapılmıştır. İnsulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri, C472T ve C422T polimorfizmlerine ait genotiplendirme işlemi için ise polimeraz zincir reaksiyonu- restriksiyon parçacık uzunluk polimorfizmi tekniği kullanılmıştır. Hardy-Weinberg eşitliğine uyum PopGene paket programı ile hesaplanmıştır. Bununla birlikte, heterozigotluk, efektif allel sayısı ve polimorfizm bilgi içeriğinden oluşan populasyon genetiği parametreleri allelik dağılım temel alınarak belirlenmiştir. İnsulin benzeri büyüme faktörü 1 geni için, A alleli frekansı iki ırk grubunda da yüksek bulunmuş ve BB genotipi gözlenmemiştir. Tiroglobulin geni için ise, TT genotipi gözlenmemiş, buna ek olarak, C allelinin ise hem Boz ırkta hem de Holstein melezlerinde neredeyse sabit olduğu belirlenmiştir. Bunun yanı sıra, oldukça düşük minör allel frekansları populasyon indekslerindeki düşük varyasyonlara sebep olmuştur. Bu çalışmadan elde edilen sonuçların insulin benzeri büyüme faktörü 1 ve tiroglobulin genleri kapsamında sığır genomunda yapılacak olan sonraki çalışmalara yararlı olabileceği düşünülmektedir.  
Keywords : sığır, Boz ırk, Holstein melezi, IGF1, TG, PCR-RFLP