Eucalyptus grandis YABBY Transkripsiyon Faktörlerinin Genom Bazında Analizi

Authors : Emre Ilhan

Pages : 158-166

Doi:10.19159/tutad.408654

View : 16 | Download : 6

Publication Date : 2018-06-30

Article Type : Research

Abstract :YABBY gen ailesi bitki transkripsiyon faktörlerinden biridir. Bu çalışmanın amacı Eucalyptus grandis bitkisinde in siliko olarak YABBY gen ailesinin üyelerini genom çapında belirlemek ve karakterize etmektir. Bu çalışmada çeşitli in siliko yöntemler kullanılmıştır. Ökaliptus genomunda 6 Egra- YABBY proteini tespit edilmiştir. Bu proteinler 18.39 ile 32.38 kDa ağırlığına sahip olup, 168-290 arasında değişen amino asitten oluşmuştur. İzoelektrik noktaları 5.54 (Egra- YABBY - 2) ile 9.92 (Egra- YABBY - 6) arasındadır. Egra-YABBY genleri arasında tahmini belirlenen ekzonların sayısı en düşük 6, en yüksek 7 olarak elde edilmiştir. Filogenetik analizler sonucunda Egra- YABBY proteinleri ile Arabidopsis thaliana ve Vitis vinifera türlerinin proteinleri 5 ana grupta (FIL, INO, CRC, YAB2 ve YAB5) kümelenmiştir. Egra-YABBY-4 / Egra-YABBY-5 genleri arasında segmental duplikasyon tespit edilmiştir. Egra-YABBY genlerinin ifade profilleri bu genlerin farklı dokularda ifade olduğunu ortaya çıkarmış ve bitkinin gelişim süresince çeşitli fizyolojik işlevlerde görev alabildiklerini de göstermiştir. Bu çalışmanın sonuçları, ökaliptus bitkisinde YABBY gen ailesinin moleküler temellerinin daha fazla anlaşılması için potansiyel biyoteknolojik kaynak ve ilave bilgiler sağlayacaktır.
Keywords : in siliko analiz, YABBY, Domain, ökaliptus, transkripsiyon faktörü, YABBY