Ordu ve Giresun İllerindeki Sicyos Türlerinin Moleküler Karakterizasyonu

Authors : Berna Nur Yeşiltaş, Onur Kolören

Pages : 37-44

View : 16 | Download : 9

Publication Date : 2019-07-04

Article Type : Research

Abstract :Sicyos spp. Doğu Karadeniz Bölgesi’nde kültür bitkilerinde, yol kenarlarında ve tarım yapılmayan alanlarda rastlanılan istilacı yabancı otlardandır. Bitki sarılıcı ve tırmanıcı yapısı ile bulunduğu ortama kolayca adapte olan ve diğer bitkilerle rekabete girerek onları baskı altına alan istilacı bir yabancı ot türüdür. Bu çalışmada Ordu ve Giresun illerinin farklı noktalarından alınan otuz Sicyos spp.’nin populasyon örneklerinin genetik karakterizasyonunun belirlenmesinde ribozomal DNA (rDNA) İnternal Transcribed Spacer (ITS) gen bölgeleri kullanılmıştır. Analizler Neighbour-Joining (NJ), Maximum-Parsimony (MP) ve Maximum-Likelihood (ML) algoritması kullanılarak yapılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre, iki haplotip bulunmuştur. Haplotip-1 ve Haplotip-2’nin sırasıyla S. davilae Rodr.-Arév. & Lira ve S. angulatus L. ile %100 oranında benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Dokuz örnek ile Haplotip-1 arasında sırasıyla %68 ve %74 (NJ/MP) oranında genetik akrabalık saptanmıştır. Altı örnek ile Haplotip-2 arasında ise sırasıyla %69, %80 ve %70   (NJ/MP/ML) oranında benzerlik bulunmuştur. S. davilae Rodr.-Arév. & Lira ülkemiz florası için yeni bir türdür.  
Keywords : Sicyos spp., ITS (İnternal Transcribed Spacer), Moleküler karakterizasyon