Rapid Characterization of Cell and Bacteria Counts using Computer Vision

Authors : Fatih Akkoyun, Adem Özçelik

Pages : 269-274

Doi:10.46810/tdfd.902441

View : 30 | Download : 16

Publication Date : 2021-06-25

Article Type : Research

Abstract :Hücre sayım işlemi, çeşitli hücre ve hücreler ile ilişkili araştırma uygulamalarında kullanılan önemli bir prosedürdür. Fen bilimleri alanında çoğu araştırmada hücreler incelenirken, hücre sayısı ve ilgili hesaplamalar ile sonuçların karşılaştırılması yapılmaktadır. Bu alandaki çalışmalarda yaygın olarak manuel olarak sayım yöntemi kullanılmaktadır. Ancak manuel sayım zaman alıcı, zorlu ve hataya meyilli bir ölçüm yöntemidir. Bu çalışmada, bilgisayarlı görüş (CV) teknolojisi kullanan otomatik hücre sayım yazılımı sunulmaktadır. Hücre ile bakteri örneklerinin otomatik sayımı deneysel çalışma yapılarak test edilmiş ve deneysel sonuçlar, manuel ve otomatik hücre sayımı yöntemlerinden elde edilen sonuçların karşılaştırılmasıyla incelenmiştir. Geliştirilmiş olan yazılım önceden tanımlanmış kullanıcı değişkenleri doğrultusunda, görüntüleri hücre/bakteri sayısını hesaplamak için incelemektedir. Yazılımın, tek türde hücre/bakteri için %99 ve karışık hücre/bakterilerde %98 sayım doğruluğuna ulaştığı görülmüştür. Buna ek olarak, aynı yazılım ile, video ve gerçek zamanlı kamera görüntüleri de aynı amaçla işlenebilmektedir. Bu çalışmada önerilmiş olan açık kaynak kodlu CV yazılımı, birçok araştırmacı tarafından, bir çok araştırmada, otomatik olarak hücre sayımının yapılmasında kullanılabilecektir.
Keywords : Makine mühendisliği, , OpenCV, , Makine görüşü, , Hücre sayımı