Correlation of the variations in prevalence of coronavirus disease 2019 and vitamin D receptor gene polymorphisms in cohorts from 26 countries

Authors : Lütfiye Karcioğlu

Pages : 60-70

Doi:10.21673/anadoluklin.987578

View : 35 | Download : 12

Publication Date : 2022-01-29

Article Type : Research

Abstract :Amaç : Bu çalışmada 26 ülkeden kohortlarda rs7975232 (ApaI), rs1544410 (BsmI), rs2228570 (FokI), rs731236 (TaqI) lokuslarında vitamin D reseptör (VDR) gen polimorfizmi sıklığı ile koronavirüs hastalığı 2019 (COVID-19) prevalans ve mortalite oranları arasındaki korelasyonu araştırmak amaçlanmıştır. Yöntem : Çalışmada rs7975232 (ApaI), rs2228570 (FokI), rs1544410 (BsmI) ve rs731236 (TaqI) lokuslarında VDR gen polimorfizmleri tanımlanmış ve sağlıklı popülasyonlarda ilgili alel frekansları bildirilmiş 26 ülke kullanıldı: İtalya, Çin, Türkiye, Japonya, Meksika, Rusya, Hindistan, Polonya, Mısır, Çekya, Etiyopya, Suudi Arabistan, Yunanistan, Hollanda, Kore, İspanya, Birleşik Devletler, Pakistan, Nijerya, Lübnan, Orta Afrika Cumhuriyeti, Finlandiya, İran, Tunus, Brezilya ve Hırvatistan. Her ülke için 6 Aralık 2020 tarihinde bildirilen COVID-19 (milyon popülasyonda) prevalans ve mortalite oranları kaydedildi. Bulgular : rs7975232’nin AA genotipi sıklığı ile COVID-19 prevalans (r=0,45; r2=0,20; p=0,02) ve mortalite (r=0,42; r2=0,17; p=0,03) oranları arasında anlamlı pozitif korelasyon saptandı. Prevalanstaki değişkenliğin %20’si ve mortalitedeki değişkenliğin %17’si AA genotipinin sıklığı ile açıklanabildi. Yine rs731236’nın TT genotipi ile COVID-19 prevalans (r=0,42; r2=0,17; p=0,03) oranları arasında anlamlı pozitif korelasyon saptandı. Prevalanstaki değişkenliğin %17’si TT genotipinin sıklığı ile açıklanabildi. rs1544410 ve rs2228570 sıklığı ile COVID-19 prevalans ve mortalitesi arasındaki korelasyonlar anlamlı değildi. Sonuç : İncelenen 26 popülasyondaki COVID-19 prevalans varyasyonları rs7975232 ve rs731236 lokuslarındaki polimorfizmler ile açıklanabilir.
Keywords : D vitamini reseptörü, korelasyon, koronavirüs hastalığı 2019, polimorfizm