Üzüm tanelerinde VvPDR genlerinin İfade Analizi

Authors : Birsen Çakir Aydemir, Selin Altintaş

Pages : 11-20

Doi:10.53501/rteufemud.1081147

View : 20 | Download : 12

Publication Date : 2022-06-30

Article Type : Research

Abstract :ATP bağlayıcı kaset (ABC) taşıyıcı membran proteinleri, tüm organizmalarda büyük oranda korunmuş en büyük membran protein ailelerindendir. Ökaryotik ABC taşıyıcılarının yapısı, bir transmembran alanı (TMD) ve bir nükleotit bağlama alanı (NBD) olarak adlandırılan iki bölgeden oluşmaktadır. Bu proteinler, ökaryot canlılarda ABCA’dan ABCG’ye kadar devam eden toplam yedi ana aileye ayrılmaktadırlar ve bu ana aileler de kendi içlerinde alt ailelere ayrılmaktadır. Plazma zarında ve tonoplast, kloroplast, mitokondri ve peroksizomlar gibi organların zarlarında lokalizedirler ve çok sayıda işlevi yerine getirmektedirler. Başlangıçta detoksifikasyon işlemlerine katılan taşıyıcılar olarak tanımlanmış olmalarına rağmen daha sonraki yapılan çalışmalarda bu proteinlerin bitki büyümesi ve gelişim dönemlerinde ve çevresel streslere karşı tepkilerde de etkili oldukları gösterilmiştir. ABCG'nin tam molekül üyelerinden PDR alt grubu sadece mantar ve bitkilerde tanımlanmıştır. Plant pleiotropic drug resistance (PDR) alt ailesine ait proteinlerin çeşitli lipidlerin ve hormonların taşınmasında görev aldıkları ve aynı zamanda bu proteinlerin abiyotik ve biyotik streslere karşı tepkiler sırasında da görevlerinin olduğu yapılan farklı çalışmalarla bildirilmiştir. Yapılan bu çalışmada ise Vitis vinifera sp. genomunda tanımlanan ve PDR alt ailesine ait VvABCG35, VvABCG36, VvABCG37 genlerinin asmada meyve gelişim dönemleri boyunca gösterdiği ifadeler incelenmiş ve bu genlerin fonksiyonları hakkında fikir sahibi olmak için STRING veritabanı kullanılarak etkileşime girdiği diğer proteinler belirlenmiştir.
Keywords : Vitis vinifera L., ABC Proteinleri, ABCG, PDR, Real Time PCR