Expression profi les of PIK3CA, RUNX3, COX-2 and DMBT1 genes in brain tumor prognosis: a preliminary study

Authors : Sunde Yilmaz, Çığır Biray Avci, Z. Özlem Doğan Şiğva, Yavuz Dodurga, Nezih Oktar, Sinem Numanoğlu, Tayfun Dalbasti, Taner Akalin, Cumhur Gündüz

Pages : 109-114

View : 27 | Download : 6

Publication Date : 2010-10-01

Article Type : Research

Abstract :Beyin tümörleri de dahil olmak üzere kanser gelişiminde önemli rol oynayan genlerin iki ana alt grubu onkogenler ve tümör baskılayıcı genlerdir. Bu ön çalışmanın amacı, tümör baskılayıcı genlerden RUNX3 (Runt-relatedtranscription factor 3), DMBT1 (Deleted in Malignant Brain Tumors 1) ve onkogenlerden PIK3CA (Fosfoinosid- 3-kinaz, katalitik, alfa polipeptid), COX–2 (Siklooksigenaz-2) genlerinin beyin tümörlerinde ifade düzeyinisaptamaktır. On dört olgunun beyin tümörü dokularından hücre kültürü ortamında çoğalması sağlandı. Kültüre edilmiş hücrelerden total RNA’lar izole edildi. Gerçek zamanlı RT-PCR metodu kullanılarak onkogen ve tümör baskılayıcı genlerin ekspresyon profi llerinin bağıl oranları saptandı. U87MG hücre hattı pozitif kontrol olarak kullanıldı. DMBT1, RUNX3, COX-2 ve PIK3CA genlerinin bağıl oranları ortalaması sırasıyla 72.2, 59.3, 0.119ve 48.5 bulundu. COX-2 aşırı ekspresyonu, anlamlı olarak azalmış sağkalım ile korelasyon gösterdi (Log-Rank,p= 0.049). DMBT1 ve RUNX3 genlerinin baskılanması azalmış sağkalımla ilişkili olduğu saptandı ancak PIK3CA, DMBT1 ve RUNX3 ekspresyonları arasında ve sağkalım üzerinde anlamlı bir farklılık saptanmadı. Yüksek COX-2 ekspresyonu klinik olarak fazla agresif beyin tümörleri ile ilişkili olduğu gösterildi. Elde ettiğimiz ön deney sonuçlarımız, COX-2 geninin terapötik hedef olarak kullanılabilir olabileceğini önermektedir.
Keywords : Beyin tümörü, gen ekspresyonu, U-87MG