- Ordu Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi
- Vol: 11 Issue: 1
- Molecular Docking Analysis of Benzimidazolium Type Molecules with VEGFR-2 and TrxR Crystal Structure...
Molecular Docking Analysis of Benzimidazolium Type Molecules with VEGFR-2 and TrxR Crystal Structures for Evaluating Anti-Cancer Activity
Authors : Elvan Üstün, Neslihan Şahin
Pages : 36-44
View : 18 | Download : 3
Publication Date : 2021-06-30
Article Type : Research
Abstract :N-heterosiklik karbenler biyoaktiviteleri dolayısıyla sıklıkla incelenen bir molekül ailesidir. Kanserin dünyada ölüme neden olan 2. hastalık olduğu için, N-heterosiklik karbenlerin anti-kanser aktivitesi de incelenen özellikler arasındadır. Bütün aday moleküllerin biyoaktivitesinin incelenmesinin zorlukları değerlendirildiğinde, in-siliko yöntemlerin öngörü elde etmek için kullanılması avantajlıdır. Teorik hesaplama yöntemleriyle, mevcut moleküllerin özellikleri incelenebildiği gibi daha uygun moleküllerin sentezlenmesi için önbilgiler elde edilebilir. Bu çalışmada daha önce karakterize edilmiş 1-(allil)-3-(2,4,6-trimetilbenzil)benzimidazolyum klorür (1) ve 1-(allil)-3-(2,3,4,5,6-pentametilbenzil)benzimidazolyum klorür (2) molekülleri DFT temelli hesap yöntemleri ile yapısal olarak incelenerek optimize edilmiştir. Optimize moleküllerin VEGFR-2 ve TrxR kristal yapıları ile etkileşimleri moleküler doking yöntemleri kullanılarak analiz edilmiştir.Keywords : N-Heterosiklik Karbenler, Anti-kanser, Moleküler Doking, DFT