- Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi
- Vol: 27 Issue: 1
- Detection and characterization of phytoplasmas in some cucurbits (Cucurbitaceae) and bindweed (Convo...
Detection and characterization of phytoplasmas in some cucurbits (Cucurbitaceae) and bindweed (Convolvulaceae) in Hatay Province of Turkey
Authors : Hakan ÇARPAR, Gülşen SERTKAYA
Pages : 166-173
Doi:10.37908/mkutbd.1041286
View : 10 | Download : 2
Publication Date : 2022-04-08
Article Type : Research
Abstract :Amaç: 2019’da bir hastalık surveyinde, şüpheli kabak bitkilerinde yaprakların sararması, bodurluk, boğum aralarının kısalması, çoklu sürgün oluşumu, tepe sürgünlerinde çalı görünümü, çiçeklerin yeşillenmesi ve kısırlık, fillodi, küçük ve şekli bozulmuş yapraklar ve gövde yassılaşması gibi fitoplazmalara özgü simptomlar gözlenmiştir. Böylelikle, bu çalışma Hatay ili kabak bitkilerinde ve tarla sarmaşığında fitoplazma hastalıklarının araştırılması amacıyla yürütülmüştür. Yöntem ve Bulgular: Hatay ili kabak tarlalarından şüpheli toplam 4 kış kabağı ( Cucurbita moschata ), 12 yaz kabağı ( Cucurbita pepo ) ve 2 tarla sarmaşığı ( Convolvulus arvensis ) örnekleri toplanmıştır. Bitkilerden bazıları (2 kış kabağı, 10 yaz kabağı ve 2 tarla sarmaşığı) fitoplazmalara özgü simptom sergilemiştir. Toplam nükleik asit izolasyonu, CTAB metoduna göre yapılmıştır. Direct ve Nested PCR çalışmalarında sırasıyla F1/R0 ve R16F2n/R2 evrensel primer çiftleri kullanılmıştır. Simptom sergileyen kabak bitkilerinde (12/12) ve tarla sarmaşığında (1/2) beklenen ~1.2 kb büyüklüğünde bant elde edilirken simptomsuz kabaklarda elde edilememiştir. Simptom gösteren örneklerden 4 tanesi NCBI Genbankası’na (MT163353, MT163393, MT163396 ve MT163469) yüklenmiştir. Genel Yorum: Sekans ve filogenetik analizlerin ardından, kabak izolatlarının " Candidatus phytoplasma trifolii” (16SrVI), tarla sarmaşığı izolatının ise " Candidatus phytoplasma solani” (16SrXII) olduğunu göstermiştir. Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Türkiye'de kabakgillerde fitoplazma enfeksiyonlarının ve doğal konakçıların durumu hakkında bilgi eksikliği bulunmaktadır. Mevcut bilgilerimize göre, Türkiye’de 16SrVI grubunun bir üyesi olan Candidatus phytoplasma trifolii'nin kışlık kabaklardan bal kabağı ( C. moschata ) ve yazlık kabaklardan sakız kabağı ( C. pepo ) bitkilerinde enfeksiyon oluşturduğu ilk kez belirlenmiştir.Keywords : Ca. phytoplasma solani, Ca. phytoplasma trifolii, Fitoplazma, Kabak, Türkiye