- Akdeniz Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi
- Vol: 33 Issue: 1
- Detection of Spiroplasma citri from citrus trees in Turkey by molecular techniques
Detection of Spiroplasma citri from citrus trees in Turkey by molecular techniques
Authors : Behçet Kemal Çağlar, Gül Satar, Saadettin Baloğlu, Mounira Inas Drais, Khaled Djelouah
Pages : 37-42
Doi:10.29136/mediterranean.657937
View : 22 | Download : 9
Publication Date : 2020-04-01
Article Type : Research
Abstract :Spiroplasma citri, kurak ve yarı kurak iklimde turunçgiller üzerindeki turunçgil palamutlaşma hastalığı (Citrus Stubborn Disease (CSD))’na neden olan bir etmendir. Bu etmenin turunçgil bahçeleri ve fidanlıklarda bulunan genç fidanlardaki enfeksiyonunun erken aşamada tespiti ve karakterizasyonu, hastalığın Spiroplasma citri’den ari bölgelere yayılmasını önlemek için büyük önem taşımaktadır. Bu çalışma, Türkiye\'deki farklı Spiroplasma citri suşlarının muhtemel varlığını araştırmak amacıyla yapılmıştır. Eylül ayında Adana ilinin Kozan ilçesinde farklı köylerde bulunan turunçgil bahçelerindeki Stubborn hastalığına benzer çoğunlukla boğum arası kısalma, yapraklarda kaşıklanma ve leke, sezon dışı çiçeklenme ve tipik küçük palamut tipi meyve simptomları gösteren ağaçlardan yaprak ve meyve örneği toplanmıştır. Türk izolatlarının saptanması ve karakterizasyonu için, polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) Spiralin-f/r, P89-r/f ve P58-6f/4r primer çiftleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Spiralin-f/r primerlerinde pozitif sonuç saptanmamıştır. Buna karşın, testlenen tüm örnekler P89-r/f ve P58-6f/4r primer çiftlerine pozitif sonuç vermiştir. P89-r/f primer çiftinden elde edilen PZR ürünleri sekanslanmış ve filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Elde edilen filogenetik ağaç, önemli bir turunçgil üretim merkezi olan Adana ilindeki turunçgil ağaçlarında saptanan Spiroplasma citri izolatlarının, Fas, Mısır ve Amerika Birleşik Devletleri (ABD)\'nden izole olanlardan daha ziyade Meksika, İspanyol, Cezayir ve İtalyan izolatlarıyla yakından ilişkili olduğunu kanıtlamıştır.Keywords : Turunçgil, Filogenetik ilişki, Gen dizileme, Stubborn