- Mantar Dergisi
- Vol: 12 Issue: 2
- Saleplerden (Orkide) İzole Edilen Endofitik Fusarium spp.’nin Moleküler Tanımlanması ve Filogenetik ...
Saleplerden (Orkide) İzole Edilen Endofitik Fusarium spp.’nin Moleküler Tanımlanması ve Filogenetik Çeşitlilik Analizleri
Authors : Yüksel Gezgin
Pages : 163-171
Doi:10.30708/mantar.956602
View : 8 | Download : 3
Publication Date : 2021-10-31
Article Type : Research
Abstract :Türkiyenin endemik bitkisi Salep (orkide) kök ve yumrulardan izole edilmiş endofitik fungus türlerinin moleküler teknikler kullanılarak tanımlanması son derece önemlidir. Bu çalışmada Salep (Orchid) bitkisinden izole edilen endofitik Fusarium Link türlerinin tanımlanması amaçlanmıştır. Bu amaçla beta-tubulin (β-tubulin: benA), Internal Transcribed Spacer (ITS) ve Translation Elongation Factor (EF) gen bölgeleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile özel primerler kullanılarak çoğaltılmıştır. Daha sonra tüm PZR ürünlerinin dizi analizi yapılmış ve GenBank’daki diğer ilgili diziler ile karşılaştırılmıştır. Fusarium izolatları tür düzeyinde Fusarium redolens Wollenw. (n=7) ve Fusarium oxysporum Schlecht. (n=3) olarak tanımlanmışlardır. Filogenetik analizler the β-tubulin, ITS ve EF gen dizilerini temel alarak gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmada, ilk olarak üç farklı gen bölgesinin çoğaltılması içeren moleküler tanımlama yöntemleri kullanılarak Türkiye’deki saleplerden (orkidelerden) izole edilen endofitik Fusarium spp. izolatları tür düzeyinde tanımlanmıştır.Keywords : Salep, Orkide, Endofitik fungus, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Fusarium redolens, Fusarium oxysporum