- Mantar Dergisi
- Vol: 12 Issue: 2
- Aspergillus Türlerinin Moleküler Tanımlanması için Hızlı, Doğru ve Düşük Maliyetli Yenilikçi Yaklaşı...
Aspergillus Türlerinin Moleküler Tanımlanması için Hızlı, Doğru ve Düşük Maliyetli Yenilikçi Yaklaşım
Authors : Yüksel GEZGİN, Sibel ARSLAN, Zeycan NURÇE
Pages : 113-121
Doi:10.30708/mantar.904921
View : 5 | Download : 2
Publication Date : 2021-10-31
Article Type : Research
Abstract :Aspergillus türlerinin bazıları ekonomik açıdan önemli tarımsal ürünleri kontamine ederek en yaygın gıda bozulmalarına sebep olan mantarlardır. Bu türler ayrıca insan sağlığını tehdit eden karsinojenik, teratojenik ve mutajenik etkilere sahip mikotoksinleri üretmektedirler. Tüm bu nedenlerden dolayı Aspergillus türlerinin kesin ve doğru tanımlamaları büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada Misel Doku-Polimeraz Zincir Reaksiyon (MD-PZR) temelli moleküler teknik geliştirilerek Polimeraz Zincir Reaksiyonunda kalıp olarak kullanılan genomik DNA basamağı ortadan kaldırılmıştır. Bu misel doku-PZR temelli moleküler tekniğinin pahalı ve özel donanım gerektirmemesi, proteinaz K, RNAaz veya başka enzimler gibi pahalı kimyasallara ihtiyaç duyulmaması, genomik DNA izolasyon işlemleri sırasında fenol/kloroform gibi toksik kimyasalların kullanılmaması gibi avantajları bulunmaktadır. Ayrıca sıvı kültür ile misel üretimine dayalı klasik DNA ekstraksiyon protokolleri zaman alıcıdır. Bu çalışmada Aspergillus izolatlarının moleküler tanımlanması için misel doku örnekleri kullanılarak iki farklı gen bölgesi (β-tubulin: benA, Calmodulin: CaM) çoğaltılmıştır. Daha sonra tüm PZR ürünleri saflaştırılıp ve dizi analizine gönderilmiştir. Sekans analiz sonuçları biyoinformatik araçlar kullanılarak incelenmiş ve izolatlar tür düzeyinde Aspergillus tubingensis (Divane Asper) R. Mosseray olarak tanımlanmışlardır.Keywords : Aspergillus, Kalmodulin Geni, Beta-Tubulin Geni, Polimeraz Zincir Reaksiyonu