- Mantar Dergisi
- Vol: 9 Issue: 1
- High-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High R...
High-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High Resolution Physical Map in Button Mushroom (Agaricus bisporus) Genome
Authors : Ali Tevfik UNCU, Ayse Ozgur UNCU
Pages : 28-35
Doi:10.30708/mantar.391682
View : 6 | Download : 2
Publication Date : 2018-04-25
Article Type : Research
Abstract :Kültür mantarı [Agaricus bisporus (J.E. Lange) Imbach], bir model organizma olmasının yanı sıra dünya genelinde yetiştirilen bir yenilebilir mantar türüdür. Bilimsel ve ekonomik önemine rağmen A. bisporus genomuna özel moleküler markör geliştirme çalışmaları ancak yakın zamanda gerçekleştirilmeye başlanmış olup, oldukça kısıtlı sayıdadır. Bu çalışma kapsamında A. bisporus genomuna özel 3943 adet yeni basit dizi tekrarı (SSR) markörü geliştirilmiştir. Geliştirilen markörler A. bisporus kromozomlarına dengeli şekilde dağılmakta olup, genomun sekans-spesifik markörler ile doyurulmasını sağlamaktadır. Çalışma kapsamında tanıtılmakta olan yüksek sayıdaki A. bisporus’a özel yeni DNA markörü, bu türde gerçekleştirilecek moleküler genetik çalışmalar için kıymetli bir kaynak teşkil edecektir.Keywords : Moleküler genetik, Biyoinformatik, Sekans-spesifik markörler, DNA markörleri