- İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi
- Vol: 85 Issue: 1
- HIGH PREVALENCE OF CLASS I AND CLASS II INTEGRONS IN UROPATHOGENIC E. COLI STRAINS (UPECs) AND THEIR...
HIGH PREVALENCE OF CLASS I AND CLASS II INTEGRONS IN UROPATHOGENIC E. COLI STRAINS (UPECs) AND THEIR RELATIONSHIP WITH ANTIBIOTIC RESISTANCE, PHYLOGENY AND VIRULENCE
Authors : Defne Gümüş, Fatma Kalayci Yüksek, Firdevs Deniz Camadan, Merve Oral, Aslı Ceren Macunluoglu, A. Mine Küçüker
Pages : 77-85
Doi:10.26650/IUITFD.984487
View : 25 | Download : 11
Publication Date : 2022-01-25
Article Type : Research
Abstract :Amaç: Gen kasetlerinin yakalanması, integrasyonu ve ekspresyonunda oldukça etkin olan integronlar, çoğul antibiyotik direncinin yayılımında önemli bir rol oynarlar. Bu çalışmada, üropatojen E. coli (UPEC) suşlarında integron varlığının antibiyotik direnci, virülans ve filogenetik gruplar ile ve filogrupların, virulans ve antibiyotik direnci ile ilişkisi araştırılmıştır. Gereç ve Yöntemler: Komplike olmayan sistit ve komplike olmayan piyelonefrit etkeni olarak izole edilen 50 UPEC suşu sınıf I, II ve III integronların varlığı ve filogruplarının belirlenmesi amacıyla PCR yöntemi ile incelenmiştir. Elde edilen sonuçlar istatistiki ilişki açısından daha önceki araştırmamızdan elde ettiğimiz bulgular ile incelenmiştir. Bulgular: Elli UPEC suşunun 37’sinin (%74) sınıf I integron, 22’sinin (%44) sınıf II integron ve bir suşun (%2) ise sınıf III integron taşıdığı belirlenmiştir. Yirmi bir (%42) suşun ise sınıf I ve sınıf II integronları birlikte taşıdığı gösterilmiştir. Suşların çoğu B2 (%38) ve E (%38) filogruplarında sınıflandırılmıştır. İntegronların varlığı ile sadece ampisilin direnci ilişkili bulunmuştur (p=0,014). İntegronların varlığı ile virulans genleri veya filogruplar arasında bir ilişki bulunmamıştır; ancak PAI (p<0,001), ompT (p=0,035) ve usp (p<0,001) genlerinin varlığı ile B2 filogrubu arasında anlamlı ilişkili bulunmuştur. Filogrup E ile ko-trimoksazol direnci arasında anlamlı ilişkili bulunmuştur (p=0,043). Sonuç: Bulgularımız literatürle de uyumlu olarak UPEC suşlarında antibiyotik direnci ile integronların (özellikle sınıf I) varlığı arasında güçlü bir ilişki olduğunu kanıtlamış ve tüm dünya genelinde integronların yaygın görüldüğü anlaşılmıştır.Keywords : Üropatojen E. coli, filogruplar, integronlar, virulans faktörleri, antibiyotik direnci