- Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 11 Issue: 2
- HnRNPA2’in LC(286-291) Domain Fibrili ve Onun D290V Mutasyonu Hakkında Teorik Bir Çalışma
HnRNPA2’in LC(286-291) Domain Fibrili ve Onun D290V Mutasyonu Hakkında Teorik Bir Çalışma
Authors : Hakan Alici
Pages : 1080-1089
Doi:10.21597/jist.845090
View : 13 | Download : 8
Publication Date : 2021-06-01
Article Type : Research
Abstract :Son zamanlarda, hnRNPA'lerin işlevindeki bozukluklar başta amiyotrofik lateral skleroz (ALS) ve frontotemporal demans (FTD) olmak üzere birçok nörodejeneratif hastalıklar ile ilişkilendirilmektedir. hnRNPA'lerin düşük karmaşıklık (LC) domainlerinin fibrilleşme eğilimlerinin bu işlev bozukluklarının temel nedeni olduğu düşünülmektedir. Bu çalışmada atomik yapısı çok yakın zamanda ortaya konulmuş D290V mutasyonuna sahip hnRNPA2'nin LC(286-291) fibril domaininin bir polimorfu (pdb kod:6WPQ) ve bu poliformun mutasyonsuz yani vahşi tip (WT) fibril formu hakkında bir moleküler Dinamik (MD) simülasyon çalışması sunuyoruz. MD simulasyon sonuçlarına göre önerilen fibril polimorf yapısı için D290V mutasyonun kararlı bir konformasyona sahip olduğu ancak onun WT formun bu fibril polimorf yapı konformasyonu için kararsız olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak çalışmada elde edilen bulgular gelecekteki muhtemel ilaç çalışmaları için yalnızca D290V fibril yapısının hedef yapı olarak ele alınabileceğini işaret etmektedir.Keywords : Düşük karmaşıklık alanı, moleküler dinamik, simülasyon, D290V