- Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 11 Issue: 1
- An Isolate of Bacillus clausii Appears to Possess Four Distinct Pectinolytic Activities
An Isolate of Bacillus clausii Appears to Possess Four Distinct Pectinolytic Activities
Authors : Sevinç Berber, Serap Çetinkaya
Pages : 635-644
Doi:10.21597/jist.768556
View : 11 | Download : 7
Publication Date : 2021-03-01
Article Type : Research
Abstract :Bakteri kaynağı olarak Koyulhisar (Sivas, Türkiye) elma bahçesi toprak örnekleri kullanıldı. Elde edilen izolatlar tür düzeyinde kısmi protein- ve 16S rRNA gen dizisi homolojisi ile belirlendi. Hepsinin Bacillus clausii olduğu belirlendi. Bu izolatlar ile kültürler hazırlandı ve hücreler uzaklaştırıldıktan sonra üst sıvıdaki proteinler organik bir çözücü yardımı ile çöktürüldü. Pektinaz taraması yapılırken, mevcut bir proteazın diğer proteinleri sindirdiği fark edildi. Bu proteolitik aktivite, inkübasyon sıcaklığının 55oC'ye çıkarılmasıyla engellendi. Dört farklı pektinaz aktivitesi, poligalakturonaz, pektin liyaz, pektat liyaz ve pektin metilesteraz bundan sonra saptanabildi. SDS-PAGE'de görüntülenen ve bu aktivitelere karşılık gelen dört protein bandı, sırasıyla 80 kDa, 58 kDa, 46 kDa ve ~ 28 kDa idi. Enzimlerin tanımlanması için spektroskopik yöntemler kullanıldı. En küçük protein bandının (28 kDa) pektin metilesteraz olduğu bulundu. Bu enzimin Km ve Vmax değerleri sırasıyla 0.4 ve 217U idi.Keywords : Bacillus clausii, pektat liyaz, pektin liyaz, pektin metilesteraz, poligalakturonaz