- Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi
- Vol: 21 Issue: 2
- Sığır karkas orijinli Escherichia coli O157 izolatlarının rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polime...
Sığır karkas orijinli Escherichia coli O157 izolatlarının rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu ile genotiplendirilmesi
Authors : Ertan Emek Onuk, Gökhan Inat, Arzu Findik, Inci Ülkü Çelikel, Alper Çiftci
Pages : 79-84
View : 17 | Download : 3
Publication Date : 2010-12-30
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışma, sığır karkas orijinli 32 adet Escherichia coli O157 izolatının iki farklı random primerin (M13 ve ERIC2) kullanıldığı rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu (RAPD-PCR) metodu ile genotiplendirilmesi ve farklı primer bağlanma ısılarının (32, 36, 38 ve 40°C) RAPD bant paternleri üzerine etkisinin değerlendirilmesi amacıyla yapılmıştır. İzolatlar M13 primeri ile 7, ERIC2 primeri ile 5 farklı genotip içerisinde dağıldı. Çalışmada kullanılan primer bağlanma ısılarının RAPD bant paternlerinin çeşitliliğini dikkate değer bir şekilde etkilemediği görüldü. Sonuç olarak E. coli O157 izolatları arasındaki çeşitliliklerin belirlenmesinde M13 primerinin daha uygun olduğu ve epidemiyolojik çalışmalarda kullanılabilir olduğu belirlendi.Keywords : Alper ÇİFTCİ, İnci Ülkü ÇELİKEL, Arzu FINDIK, Ertan Emek ONUK, Gökhan İNAT, Escherichia coli O157, genotiplendirme, primer bağlanma ısısı, RAPD-PCR., 2010, Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi