- Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi
- Vol: 30 Issue: 1
- Molecular characterization of Hysterothylacium aduncum (Nematoda: Raphidascarididae) larvae infectin...
Molecular characterization of Hysterothylacium aduncum (Nematoda: Raphidascarididae) larvae infecting Merlangius merlangus euxinus (Linnaeus, 1758) from the Turkish Black Sea coast based on mitochondrial small subunit ribosomal RNA gene analysis
Authors : Gökmen Zafer Pekmezci
Pages : 64-69
Doi:10.35864/evmd.562427
View : 8 | Download : 1
Publication Date : 2019-06-30
Article Type : Research
Abstract :Türkiye sularında Hysterothylacium cinsinin taksonomisi eksik ve belirsizdir. Bu araştırmada Türkiye’nin Karadeniz kıyılarında avlanan Merlangius merlangus euxinus ’da H. aduncum larvaları morfolojik olarak teşhis edildi. H. aduncum ’un nükleer ribozomal ITS gen bölgesi (ITS-1, 5.8S subunit, ITS-2) ile küçük alt ünite mitokondriyal ribozomal RNA (rrnS) gen bölgesi çoğaltıldı ve sekanslandı . BLAST analizleri H. aduncum ’un mevcut ITS dizilerilerinin daha önce Türkiye Karadeniz’den kayıt edilen H. aduncum ’un referans dizisiyle (erişim numarası JX413596) aynı olduğunu gösterdi. Türkiye Karadeniz’den H. aduncum türünün rrnS geni (MK886768), H. aduncum 'un Akdeniz (MF000685-MF000691) ile Çin sularındaki (MF140344) izolatları ile %97.94-99.56 arasında benzerlik gösterdi. Bununla birlikte, Türkiye Karadeniz’den elde edilen H. aduncum ’un rrnS dizisi ile H. aduncum 'un Akdeniz (MF000685-MF000691) ile Çin sularındaki (MF140344) diğer izolatlarının ikili karşılaştırmasında %0,2 ile %1,7 arasında farklılık gözlendi. Bu çalışma ile ilk kez Karadeniz'den H. aduncum ’un mitokondriyal rrnS geni moleküler olarak karakterize edildi.Keywords : Hysterothylacium aduncum, Moleküler Karakterizasyon, Mitokondriyal rrnS geni, Karadeniz, Türkiye