- Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 28 Issue: 1
- HIV-1 Proteaz Özgünlüğünün Yeni Bir Öznitelik Temsili Yöntemi ile Proteomik Analizi
HIV-1 Proteaz Özgünlüğünün Yeni Bir Öznitelik Temsili Yöntemi ile Proteomik Analizi
Authors : Murat Gök, Ahmet Turan Özcerit
Pages : 23-28
View : 8 | Download : 3
Publication Date : 2012-02-01
Article Type : Other
Abstract :Bu çalışmada HIV-1 proteaz enzimi bölünme kısımlarının tahmini için Fizikokimyasal Tabanlı Kodlama Yöntemi (FTKY) adı verilen yeni bir öznitelik kodlama yöntemi uygulandı. FTKY, seçilen en iyi 10-fk (fizikokimyasal), 20-fk, 30-fk, 40-fk ve 50-fk özelliğe göre sınıf doğruluğu, duyarlık ve Alıcı İşletim Karakteristiği Eğrisi Altında Kalan Alan (AİKAA) değerleri bakımından Doğrusal Destek Vektör Makineleri (DDVM) yöntemi kullanılarak test edilmiştir. Testlerde güncel iki HIV-1 proteaz veri seti, PR-1625 ve PR-3261 kullanılmıştır. Elde edilen deneysel sonuçlara göre 10-fk’ya göre yapılan kodlamalarda, PR-1625 veri seti üzerinde en yüksek performans elde edilirken PR-3261’de ise en düşük performans elde edilmiştir. Elde edilen deneysel sonuçlara göre FTKY, tek sınıflandırıcı üzerinde PR-1625 üzerinde en yüksek sınıf doğruluğunu % 95,21 ile en iyi 10-fk, PR-3261 üzerinde ise % 94,37 sınıf doğruluğu ile en iyi 30-fk vermiştir.Keywords : HIV-1 Proteaz Özgünlüğü, Öznitelik Temsili, Peptit Sınıflandırma