- Bor Dergisi
- Vol: 5 Issue: 4
- Orta ve şiddetli seviyelerde bor toksisitesinin Arabidopsis thaliana’da miR393 ekspresyonu üzerine e...
Orta ve şiddetli seviyelerde bor toksisitesinin Arabidopsis thaliana’da miR393 ekspresyonu üzerine etkisi
Authors : Ceyhun Kayihan
Pages : 183-191
Doi:10.30728/boron.783209
View : 15 | Download : 7
Publication Date : 2020-12-29
Article Type : Research
Abstract :Bitkilerde korunmuş olan mikroRNA (miRNA) ailelerinden biri olan miR393, birçok kritik gelişimsel süreçlerde rol oynamaktadır. Bu çalışmada, Stem-Loop (SL) kantitatif ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile 1 mM (1B) ve 3 mM (3B) borik aside maruz kalan Arabidopsis thaliana'da miR393’ün ekspresyon seviyeleri belirlenmiştir. Ayrıca, miR393’ün Arabidopsis thaliana’da hedeflediği genler ve bu genlerin Gen Ontoloji Zenginleştirme analizi yapılmıştır. Arabidopsis thaliana bitkisinde toksik seviyelerde B uygulaması sonrası, Arabidopsis fideciklerinin büyümesinde düşüş ve fideciklerin yaprak uçlarında klorosis gözlemlenmiştir. Arabidopsis thaliana’da 1B uygulaması miR393 ekspresyonu 2,9 kat artırırken, 3B uygulaması 2.7’lik bir artışa sebep olmuştur. miR393’ün 5’ve 3’ ucundaki olgun dizilere göre (5p ve 3p) başlıca hedef genleri; auxin sinyal F-box, S-adenosil-L-metiyonin- bağımlı metiltransferaz süper familya proteini, Kinezin benzeri kalmodulin-bağlanma proteini, Lösin-zengin reseptör benzeri protein kinaz familya proteini, 1- deoksi-D-ksilüloz 5-fosfat sentaz, ARM tekrar süper familya proteini, myb-benzeri HTH transkripsiyonel regülatör familya proteini ve bHLH, ve WRKY33 transkripsiyon faktörleridir. Öte yandan, miR393’ün hedeflediği genlerin Gen Ontoloji (GO) Zenginleştirme analizine göre başlıca Biyolojik Süreçleri şu şekildedir: Oksin ile aktifleşmiş sinyal yolağı, oksin uyarısına hücresel cevap, çeşitli gelişim süreçleri ve farklı hücresel cevaplardır. Moleküler Fonksiyonlar ise, oksin bağlayıcı, inositol heksakisfosfat bağlayıcı ve hormon ve alkol bağlayıcı şeklinde kategorize edilebilir. Sonuç olarak, B toksisitesi altında tespit edilen büyüme geriliği miR393 hedefli oksin regülasyonu ve bHLH gibi ilişkili transkripsiyon faktörleri ile ilgili olabilir.Keywords : Arabidopsis thaliana, Bor, Ekspresyon, MiR399, Toksisite