- Bayburt Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
- Vol: 5 Issue: 2
- Molecular Docking Analysis on the Antiviral Effects of Curcumin on SARS-CoV-2
Molecular Docking Analysis on the Antiviral Effects of Curcumin on SARS-CoV-2
Authors : A. Demet Demirag, Sefa Çelik, Ayşen Özel, Sevim Akyüz
Pages : 223-228
Doi:10.55117/bufbd.1138678
View : 13 | Download : 3
Publication Date : 2022-12-31
Article Type : Research
Abstract :Kurkumin (C21H20O6) molekülünün yapısal tercihleri Spartan06 programı kullanılarak MMFF yöntemi ile analiz edilmiş ve en kararlı geometri belirlenmiştir. Kurkuminin SARS-CoV-2 üzerindeki etkilerini değerlendirmek için, SARS-CoV-2 ana proteaz enziminin (Mpro) apo/holo formları ve spike glikoprotein ile moleküler kenetlenme çalışmaları yapılmıştır. SARS-CoV-2 proteinlerini hedefleyen kurkuminin bağlanma afiniteleri ve bağlanma modları belirlenmiştir. Kurkuminin ana proteaz enziminin (Mpro) apo ve holo formlarına ve spike glikoproteine bağlanma afiniteleri sırasıyla -7.3, -5.7 ve -7.6 kcal/mol olarak bulunmuştur. Sonuçlar, kurkuminin COVID-19 tedavisi için potansiyel bir terapötik ajan olabileceğini göstermiştir.Keywords : COVID-19, Kurkumin, Antienflamatuvar, Konformasyon analizi, Moleküler Kenetlenme