- Mediterranean Agricultural Sciences
- Vol: 33 Issue: 1
- Determination of SacII and MboII polymorphisms in the Nerve Growth Factor (NGF) gene in four native ...
Determination of SacII and MboII polymorphisms in the Nerve Growth Factor (NGF) gene in four native Turkish goat populations
Authors : Eymen Demir, Bahar Argun Karsli, Taki Karsli, Murat Soner Balcioğlu
Pages : 145-148
Doi:10.29136/mediterranean.633476
View : 14 | Download : 3
Publication Date : 2020-04-01
Article Type : Research
Abstract :Sinir Büyüme Faktörü ( NGF ) geni yumurtalık hücrelerinin yaşamını devam ettirmesi ve çoğalmasında önemli fonksiyonlara sahiptir. Keçi NGF geni üzerinde yapılan son çalışmalar, iki SNP’in ( Sac II /C291A ve Mbo II /A705G polimorfizmi) vücut uzunluğu ve bir batında doğan yavru sayısı ile ilişkili olduğunu ortaya çıkarmıştır. Bu çalışmada, Türkiye’de yetiştirilen Kıl (HAI), Kabakulak (KBK), Honamlı (HNM) ve Norduz (NRD) keçi populasyonlarının NGF geninde Sac II ve Mbo II polimorfizminin PCR-RFLP yöntemiyle belirlenmesi amaçlanmıştır. NGF geninde farklı genotiplerin belirlenmesi için çoğaltılan 808 bç uzunluğundaki PCR ürünleri Sac II, 319 bç uzunluğundaki PCR ürünleri ise Mbo II restriksiyon enzimi ile kesilmiştir. NGF / Sac II polimorfizminde A allel frekansı 0.500 (Kıl, Honamlı ve Kabakulak) ile 0.950 (Norduz) aralığında değişirken, C allel frekansı 0.025 (Norduz) ile 0.500 (Kıl, Honamlı ve Kabakulak) aralığında değişmiştir. NGF / Mbo II polimorfizminde A allel frekansı 0.213 (Kıl) ile 1.000 (Norduz) aralığında değişirken, G allel frekansı 0.000 (Norduz) ile 0.787 (Kıl) aralığında değişmiştir. Honamlı populasyonunda HW dengesinden sapma önemli bulunmuştur ( P < 0.05). Bu çalışmada, Türkiye’nin yerli keçi populasyonlarında keçi NGF gen polimorfizmi ilk defa ortaya çıkarılmıştır. Bu çalışmandan elde edilen sonuçlar, NGF /Sac II polimorfizminin Norduz popuslayonunda vücut uzunluğu, için, NGF /Mbo II polimorfizminin ise Kıl, Honamlı ve Kabakulak populasyonlarında bir batında doğan yavru sayısı için markör destekli seleksiyon (MAS) çalışmalarında kullanılabileceğini göstermiştir.Keywords : Vücut uzunluğu, Yavru sayısı, Sinir Büyüme Faktörü, NGF, PCR-RFLP