- Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 23 Issue: 2
- Defining phylogenetic relationship between the genera Opopanax and Crenosciadium using nuclear and c...
Defining phylogenetic relationship between the genera Opopanax and Crenosciadium using nuclear and chloroplast DNA sequence data
Authors : Taner Özcan, Özlem Çetin, Mustafa Çelik, Fatih Albayrak
Pages : 716-731
Doi:10.25092/baunfbed.930696
View : 19 | Download : 5
Publication Date : 2021-07-04
Article Type : Research
Abstract :Opopanax ve Crenosciadium üzerine filogenetik bir çalışma, cinslerin sınırlarını ve cinsler arası ilişkilerini aydınlatmak için yapıldı. Çekirdek DNA’sından ITS, kloroplast DNA’sından matK ve trnL-F'’den elde edilen dizi verileri, filogenetik ilişkilerini belirlemek için kullanıldı. Tüm bölgelerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) amplifikasyonları evrensel primerler kullanılarak yapıldı. Maksimum Olabilirlik (ML) ağaçları, PAUP* yazılımı kullanılarak oluşturuldu, ITS dizilerinin nod yaşlarını gösteren bir diğer filogenetik ağacı MrBayes programından elde edildi ve Komşu Ağ Diyagramları, Splits Tree Programı kullanılarak oluşturuldu. Sonuçlarımız, Smyrniopsis ve Opopanax'ın Petroedmondia syriaca, Magydaris panacifolia ve Crenosciadium siifolium ile güçlü bir şekilde yakın ilişkili olduğunu açıkça gösterdi.Keywords : Opopanax, Crenosciadium, Apiaceae, Filogeni.