- Horticultural Studies
- Vol: 35 Issue: 2
- Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts
Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts
Authors : Ilknur Polat, Görkem Sülü, Aytül Kitapci, Emine Gümrükçü, Ömür Baysal
Pages : 121-134
Doi:10.16882/derim.2018.410051
View : 20 | Download : 6
Publication Date : 9999-12-31
Article Type : Makaleler
Abstract :Botrytis cinerea (teleomorph: Botryotinia fuckeliana ) örtüaltı sebze yetiştiriciliğinde kurşuni küf hastalığı etmenidir. Patojende oluşan farklılıkların bilinmesi hastalıkla mücadelenin etkinliğini arttırmaktadır. Çalışmada, Türkiye’nin Antalya ilinde yer alan 36 farklı seradan 42 adet izolat kullanılmıştır. On iki SRAP (sequence-related amplified polymorphism) primer kombinasyonu ve 18 ISSR (inter simple sequence repeat) primeri dereotu, fesleğen, marul, fasulye, hıyar, domates, biber ve patlıcandan elde edilen B. cinerea izolatlarının genetik farklılıklarının belirlenmesinde oldukça yüksek polimorfizm sağlamışlardır. ISSR ve SRAP markırlardan elde edilen sonuçlar UPGMA (The unweighted pair-group method with arithmetic average analysis) analizine göre izolatlar arasında 0.15-0.90 oranında değişen benzerlik elde edilmiştir. Ayrıca, cophenetic correlation değeri r=0.93 ile oldukça yüksek bulunmuştur. Cluster analizi sonuçları değerlendirildiğinde marul izolatları diğer izolatlara göre oldukça uzak kümelenmiştir. Ayrıca, tüm izolatlar için tranpozabl elementler ( Flipper ve Boty ) araştırılmış ve sadece Flipper element tespit edilmiştir. Elde edilen genetik karakterizasyon sonuçlarına göre, B. cinerea populasyonunda oldukça yüksek seviyede genetik farklılıklar bulunmuştur. Bu durum, B. cinerea’ nın evrimselleşme potensiyeli ve gen akışlarından kaynaklanabilir. Farklı konukçulardan elde edilen bu patojenin genetik farklılıklarının belirlenmesinde kullanılan moleküler markırlar, ileride yapılacak çalışmalara da ışık tutmaktadır.Keywords : ISSR, SRAP, ISSR, SRAP, Kurşuni küf, Genetik farklılık, Konukçu farklılığı, ISSR, SRAP, Transpoazabl elementler