- Hayvansal Üretim
- Vol: 61 Issue: 2
- Comparing Autosomal SSR and PCR-RFLP Markers to Determine Phylogenetic Relationship Based on Genetic...
Comparing Autosomal SSR and PCR-RFLP Markers to Determine Phylogenetic Relationship Based on Genetic Distances in Livestock
Authors : Taki Karsli, Eymen Demir, Bahar Argun Karsli, Hüseyin Göktuğ Fidan, Murat Balcioğlu
Pages : 135-141
Doi:10.29185/hayuretim.709504
View : 10 | Download : 6
Publication Date : 2020-12-29
Article Type : Research
Abstract :Amaç: Çiftlik hayvanlarında filogenetik ilişkini n analizi için çok sayıda moleküler araç nmaktadır. Günümüzde çiftlik hayvanı ırk ve tiplerinde filogenetik ilişkinin belirlenmesinde Basit Dizi Tekrarları ve Tek Nükleotid Polimorfizmleri en yaygın kullanılan moleküler tekniklerdir. Bununla birlikte, bütçe ve zaman gibi sınırlayıcı koşullarda filogenetik analiz yapabilmek için alternatif moleküler teknikler tercih edilebilir. Bu bağlamda, mevcut çalışmada genetik mesafe temelli filogenetik ilişkinin ortaya çıkarılmasında Basit Dizi Tekrarları ve Polimeraz Zincir ReaksiyonuRestriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi teknikleri karşılaştırılmıştır. Materyal ve Metot: Bu çalışmada filogenetik ilişki analizi için 11 farklı yumurtacı saf hattın her birinden 30’ar birey 11 PCR-RFLP ve 17 SSR lokus temelinde genotiplendirilmiştir. Bulgular: Genetik mesafe temelinde oluşturulan UPGMA dendogramı bakımından her iki teknik benzer sonuçlar göstermiştir. Hem Polimeraz Zincir ReaksiyonuRestriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi hem de Basit Dizi Tekrarları tekniği ile beyaz ve kahverengi yumurtacı hatlar genetik köken ve yetiştirilme geçmişlerine uygun olarak ayrılmıştır. Sonuç: Bütçe, zaman ve laboratuvar alt yapısı kısıtlı olduğunda, genetik mesafe temelli filogenetik ilişkinin incelenmesinde Polimeraz Zincir Reaksiyonu- Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi tekniğinin kullanılabileceği önerilmektedir.Keywords : Çiftlik hayvanları, UPGMA dendogramı, moleküler markerler, filogeni