- Hayvansal Üretim
- Vol: 58 Issue: 2
- Trakya Bölgesindeki Bal Arılarında (Apis mellifera L.) mtDNA 16S rDNA ve ND5 Genleri Analizi
Trakya Bölgesindeki Bal Arılarında (Apis mellifera L.) mtDNA 16S rDNA ve ND5 Genleri Analizi
Authors : Raziye Işik, Fulya Özdil, Ayşe Güder
Pages : 7-14
Doi:10.29185/hayuretim.342734
View : 15 | Download : 5
Publication Date : 2017-11-23
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışmada, Türkiye’nin Trakya bölgesinde bulunan bal arısı populasyonlarında genetik varyasyon mitokondriyel genomda 16S rDNA ve ND5 gen bölgeleri kullanılarak araştırılmıştır. PCR-RFLP ve DNA dizi analizi yöntemlerinden yararlanılarak 16S rDNA ve ND5 gen bölgeleri Dra I , Mbo II ve Swa I restriksiyon enzimleri ile incelenmiştir. Trakya bölgesinin Tekirdağ, Edirne, Kırklareli illeri ile Çanakkale ve Gökçeada’nın farklı yörelerinden olmak üzere toplam 100 adet işçi arı örneği materyal olarak kullanılmıştır. Bu çalışmada, 16S rDNA ve ND5 gen bölgelerinin Dra I ve Swa I restriksiyon enzimleri ile kesiminde iki farklı haplotip elde edilmiştir. 16S rDNA/ Dra I kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde 6 kesim noktası tespit edilmiş ve 315, 212, 116, 116, 92, 70 ve 44 bç'lik kesim profili elde edilmiştir. Tip 2 haplotipinde ise, C → T transizyonu sonucu 705. pozisyonda meydana gelen nokta mutasyonu sonucu ilave bir kesim noktası daha oluşmuş ve bu haplotipte 8 bantlık kesim profili elde edilmiştir (215, 212, 116, 116, 100, 92, 70 ve 44 bç). 16S rDNA/ Swa I kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde iki kesim noktası sonucu 359, 324 ve 282 bç’lik kesim profili tespit edilmiş, aynı gen bölgesinin 196. nükleotidinde meydana gelen A→T transversiyonu sonucu yeni bir kesim noktası daha oluşmuş ve 359, 324, 195 ve 87 bç’lik 4 bant veren kesim profili elde edilmiştir. Fakat bu bölgenin Mbo II restriksiyon enzimi ile kesimi sonucunda tüm örneklerde 16S rDNA/ Mbo II bakımından tek tip haplotip belirlenmiştir. ND5 gen bölgesinde ise sadece Dra I restriksiyon enzimi ile kesim sonucunda varyasyon elde edilmiştir. ND5/ Dra I kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde 440, 270 ve 112 bç’lik kesim profili elde edilirken, aynı gen bölgesinin 383. pozisyonda meydana gelen T→C transizyonu sonucu Dra I restriksiyon enzimi kesim noktası kaybolmuş ve 552 ve 270 bç’lik 2 banttan oluşan kesim profili elde edilmiştir. ND5 bölgesinin Mbo II ve Swa I restriksiyon enzimleri ile kesiminde varyasyon bulunmamış ve tüm örneklerde tek tip haplotip elde edilmiştir.Keywords : Apis mellifera L., mtDNA, 16S rDNA, ND5, PCR-RFLP