- Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi
- Issue: 17
- Comparison of DNA extraction protocols for PCR-based techniques in wheat
Comparison of DNA extraction protocols for PCR-based techniques in wheat
Authors : Özlem Ateş Sönmezoğlu, Begüm Terzi
Pages : 860-865
Doi:10.31590/ejosat.646491
View : 24 | Download : 9
Publication Date : 2019-12-31
Article Type : Research
Abstract :Moleküler biyoloji ve genetik çalışmalar, bitkilerden izole edilmiş yüksek kaliteli DNA gerektirir. Bu nedenle, saf ve yüksek kalitede DNA'nın kısa sürede izolasyonu önemlidir. Bununla birlikte, farklı bitkiler farklı kimyasal bileşime sahip olduklarından, yakın türlerde bile spesifik genomik DNA izolasyon protokolüne ihtiyaç vardır. Buğday için çok sayıda protokol vardır. Bu nedenle, hangi yöntemin daha uygulanabilir, daha güvenli ve daha kolay olduğu belirlenmelidir. Bu amaçla üç DNA ekstraksiyonu protokolü kullanılmıştır. Bu protokollerden elde edilen DNA örneklerinin saflıkları ve konsantrasyonları karşılaştırılmıştır. Elde edilen DNA'nın kalitesi ve miktarı NanoDrop Spektrofotometre (A260 / 280 absorbans) ve agaroz jel elektroforezi ile belirlenmiştir. Ayrıca, ekstrakte edilen DNA'lar polimeraz zincir reaksiyonları (PCR) ile amplifiye edilmiş ve izole edilmiş DNA'ların PCR reaksiyonları için uygunluğu da belirlenmiştir. Sonuçlar, CTAB DNA ekstraksiyon yöntemiyle diğer protokollere kıyasla buğdayda (Triticum avestivum L.) en yüksek DNA konsantrasyonlarının elde edildiğini göstermiştir.Keywords : DNAizolasyonu, buğday, PCR, SSR