- Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi
- Vol: 51 Issue: 2
- Plati Balığı, Xiphophorus maculatus Günther, 1866’nda Glutatyon Redüktaz Geninin Biyoenformatiği...
Plati Balığı, Xiphophorus maculatus Günther, 1866’nda Glutatyon Redüktaz Geninin Biyoenformatiği
Authors : Mehtap Bayir
Pages : 159-167
Doi:10.17097/ataunizfd.631335
View : 8 | Download : 3
Publication Date : 2020-05-19
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışmada, plati balığı, Xiphophorus maculatus’ta antioksidan enzim genlerinden, glutatyon redüktaz (gsr)’ın genomik organizasyonu belirlenmiştir. Bu amaçla genin tanımlanması yapılmış, ekzon- intron organizasyonu, TATA kutusu, poli A kuyruğu ve genin üretmiş olduğu amino asitler belirlenerek gen yapısı bir tablo şeklinde sunulmuş, gsr gen kromozom bölgeleri tespit edilmiştir.Ayrıca bu bölgede bulunan genlerin, diğer bazı model organizmalarda ve insanda bulunduğu gen bölgeleri belirlenerek korunmuş gen sentezi oluşturulmuş, diğer omurgalılar tarafından kodlanan amino asit dizileri belirlenmiş ve bu organizmalarla olan filogenetik ilişkitespit edilerek, gen yapılarının benzerlik-özdeşlik oranlarının % olarak değeri belirlenmiştir. Çalışmada NCBI veritabanı, Ensembl genomik veritabanı, MEGA 6 programı ve BioEdit yazılımı kullanılarak elde edilen istatistikler değerlendirilmiştir. Balıkların stress faktörlerine göstermiş oldukları tepkiler, farklı gen ürünlerinin etkilerini içeren çok yönlü seviyelerin ortaya çıkmasına neden olabilir. Dolayısıyla moleküler çalışmalarla ölçülebilecek bir balık stress tepkisive bu balığın genetik özelliklerinin araştırılması ve anlaşılması moleküler çalışmalar açısından büyük önem taşıdığı için, biyoenformatik araçlar kullanarak önemli bir model organizma olan plati balığı, X. maculatus’ta, gsr’nin karakterizasyonu ve tanımlanması yapılmış ve balıklarda moleküler stres tepkisi üzerine yapılacak olan çalışmalarda kullanılacak birtakım veriler bu çalışma ile bilim dünyasına sunulmuştur.Keywords : Plati balığı, Genomik organizasyon, gsr, Model organizma