- Trakya University Journal of Natural Sciences
- Vol: 21 Issue: 1
- FIRST REPORT OF Cucumis melo endornavirus WITH A NEW HOST, THE GHERKIN (Cucumis anguria Linn.), IN T...
FIRST REPORT OF Cucumis melo endornavirus WITH A NEW HOST, THE GHERKIN (Cucumis anguria Linn.), IN TURKEY
Authors : Ali Karanfil, Savaş Korkmaz
Pages : 63-67
Doi:10.23902/trkjnat.688646
View : 14 | Download : 2
Publication Date : 2020-04-15
Article Type : Research
Abstract :Dünyada gerçekleştirilen çalışmalar sonucunda kabakgil familyasındaki bitkileri enfekte eden 50'den fazla virüs varlığı tanımlanmıştır. Virüs tespit metotlarındaki gelişmelere bağlı olarak bu sayıya her geçen gün yenileri eklenmektedir. Son yıllarda tanılanan bu virüs hastalıklarından bir tanesi de Cucumis melo endornavirus (CmEV)'dır. CmEV'nin enfeksiyonu dünyanın farklı ülkelerinden bildirilmiştir. Ancak, ülkemizde şimdiye kadar CmEV varlığının belirlenmesine yönelik bir çalışma gerçekleştirilmemiştir. Bu amaçla, Manisa ve İzmir illerinden virüs ve virüs-benzeri belirti gösteren 59 kabakgil bitkisinden örnekler alınmıştır. Toplanan örnekler ters transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu ile test edilmiştir. Gerçekleştirilen bu testler sonucunda 47 örnekte CmEV enfeksiyonu tespit edilmiştir. Enfekteli 47 örneğin 44 tanesi kavun (Cucumis melo Linn.), kalan 3 örnek ise acurdur (C. anguria Linn.). Enfekteli örnekler arasından, beş tanesi (üç tanesi kavun, iki tanesi acur) sekans analizleri için seçilmiştir. Gerçekleştirilen sekans analizleri sonucunda CmEV izolatları kendi aralarında nükleotit düzeyinde %93-99, amino asit düzeyinde ise %94-99 benzerlikler gösterdiği belirlenmiştir. Dünya izolatları ile yapılan benzerlik analizleri sonucunda ise nükleotit düzeyinde %93-98, amino asit düzeyinde ise %91-98 benzerlikler tespit edilmiştir. Gerçekleştirilen bu çalışma ile ülkemizde ilk kez CmEV enfeksiyonu kavun ve dünya için yeni bir konukçu kaydı olan acur bitkisinde tespit edilmiştir.Keywords : Melon, gherkin, virus, CMeV