- Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences
- Vol: 5 Issue: 4
- Phenotypic, Phylogenetic Characterization and Antimicrobial Susceptibility Determination of Chryseob...
Phenotypic, Phylogenetic Characterization and Antimicrobial Susceptibility Determination of Chryseobacterium piscicola Isolates Recovered from Diseased Rainbow Trout
Authors : Izzet Burcin Saticioglu, Soner Altun, Muhammed Duman
Pages : 624-629
Doi:10.35229/jaes.808537
View : 25 | Download : 6
Publication Date : 2020-12-31
Article Type : Research
Abstract :Çalışmamızda iştahsızlık, ekzoftalmus, renkte kararma ve sırt yüzgeci erozyonu belirtileri gösteren 1-4 gram ağırlıkları arasında gökkuşağı alabalıklarından izole edilen oniki izolat kullanılmıştır. Konvansiyonel mikrobiyolojik testlerin yanı sıra Biolog GENIII mikroplate kullanılarak geniş kapsamlı fenotipik karakterizasyon yapılmıştır. 16S rRNA bölgesi kullanılarak moleküler identifikasyon ve karakterizasyon yapılmıştır. Çalışmada kullanılan izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. 16S rRNA bölgesine dayalı dizi analizi ile yapılan moleküler identifasyonda izolatlarımız %99 oranında Chryseobacterium piscicola olarak tanımlanmıştır. İzolatlarımız, Amerika, Şili ve Finlandiya’daki üç farklı konakçıdan elde edilen izolatlarla yapılan filogenetik analizde yüksek benzerlik oranı ile beş farklı genogrup belirlenmiştir. Finlandiya, Şili ve ABD'den izole edilen izolatlar ve C-316 (Türkiye) izolatı aynı genogrupta bulunmuştur. 16S rRNA bölgesi ile oluşturulan filogenetik analizin bakterinin izole edildiği konakçı ayrımının yapamadığı görülmüştür. Filogenetik analize göre seçilen altı temsili izolatın fenotipik özellikleri Biolog GENIII mikroplakası ile belirlenmiştir. Temsili izolatların Biolog GENIII sonuçlarına göre, 94 testin 40'ının sonuçlarının değişken olduğu bulunmuştur. Bu sonuçla, C. piscicola izolatlarının fenotipik olarak homojen bir yapıda olmadığı görülmüştür. Ayrıca çalışmamızda izolatlarımızın florfenikol, enrofloksasin ve sülfametoksazol/trimetoprime karşı oluşan zon çaplarının diğerlerine göre daha yüksek olduğu ve C-41’in en dirençli izolat olduğu bulunmuştur.Keywords : Flavobacteriaceae, Chryseobacterium piscicola, Gökkuşağı alabalığı