- Hacettepe Journal of Biology and Chemistry
- Vol: 51 Issue: 1
- Molecular Docking Mediated Virtual Drug Screening for GABAA Receptor: Promising Digoxin Derivatives
Molecular Docking Mediated Virtual Drug Screening for GABAA Receptor: Promising Digoxin Derivatives
Authors : Hüseyin Saygın Portakal
Pages : 71-91
Doi:10.15671/hjbc.1139995
View : 13 | Download : 4
Publication Date : 2023-01-01
Article Type : Research
Abstract :Memeli türlerinin merkezi sinir sisteminde (MSS) ℽ-aminobütirik asit (GABA), nöral farklılaşma, çoğalma, göç vb. yolakları düzenleyen nöronal gelişim için birincil inhibitör nörotransmiterdir. GABAA reseptörü MSS içindeki diğer GABA reseptörleri arasında en yüksek ekspresyon seviyesine sahip olduğu için majör GABA reseptörüdür. GABAerjik yolaktaki bozuklukların şizofreni, epilepsi, anksiyete, depresyon, uykusuzluk gibi ciddi hastalıklara yol açabileceğini gösteren pek çok kanıt bulunmaktadır. Bu çalışmada FDA Onaylı İlaçlar, Dünyaca Onaylı Ama FDA Onaylı Olmayan İlaçlar ve İnsan Dışı Metabolitler olarak üç farklı verisetinden oluşan toplam 8170 ligand içeren ilaç kütüphanesi GABAA reseptörünün allosterik bölgesi için PyRx Virtual Screening Tool ile taranmış ve ligand-reseptör etkileşimleri Biovia Discovery Studio yazılımı ile analiz edilmiştir. Sonuçlar, Digoksin ve iki farklı türevinin (DD1 ve DD2) ve ayrıca Conivaptan'ın GABAerjik yolak temelli bozuklukların tedavisinde umut verici olduğunu ortaya koymaktadır. Bu raporun bulguları daha ileri moleküler dinamik (MD) simülasyonları ile doğrulanmalı ve ligandlar hem in vitro hem de in vivo çalışmalarla test edilmelidir.Keywords : Sanal ilaç tarama, Moleküler yanaştırma, GABA, GABAerjik yolak, Merkezi sinir sistemi, Sinir sistemi bozuklukları