- Hacettepe Journal of Biology and Chemistry
- Vol: 42 Issue: 2
- Determination of acidic dissociation constants of L-phenylalanyl-glycine and L-alanyl-L-alanine in w...
Determination of acidic dissociation constants of L-phenylalanyl-glycine and L-alanyl-L-alanine in water using ab initio methods
Authors : Farhoush Kiani, Mahmoud Tajbakhsh, Fereydoon Ashrafi, Nesa Shafiei, Azar Bahadori, Fardad Koohyar
Pages : 263-274
View : 7 | Download : 3
Publication Date : 2014-06-01
Article Type : Other
Abstract :A sidik ayrışma sabiti organik bileşiklerin en temel özelliklerinden birisidir. Bu çalışmada, yoğunluk fonksiyon teori DFT hesaplamaları 6-31+G d ile B3LYP birleştirilmiş temel setler L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-Lalaninin asidik ayrışma sabitlerinin belirlenmesinde uygulanmıştır. L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin sulufaz pK değeri hesaplamaları için ab initio yöntemi sunulmuştur. Mevcut türler ve su arasında oluşan moleküller arası hidrojen bağlarının oluşumu Tomasi yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. Bu şekilde, su molekülleri ile solvate olmuş L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin katyonu, anyon ve nötr türleri bazik sulu çözeltilerde belirlenmiştir. Ayrıca, bu dipeptidlerin pKa değerleri arasındaki ilişki teorik olarak incelenmiş ve kıyaslanabilir uyumlu deneysel sonuçlar bulunmuşturKeywords : Asitlik sabiti, L-fenilalanil-glisin, L-alanil-L-alanin, çözünme serbest enerjisi, ab initio yöntemleri