- Cukurova Medical Journal
- Vol: 47 Issue: 1
- Molecular epidemiological typing of M. tuberculosis isolates isolated from Turkey's Eastern Anatolia...
Molecular epidemiological typing of M. tuberculosis isolates isolated from Turkey's Eastern Anatolia with in house PCR method
Authors : Elif Aydin, Gülnur Tarhan, Funda ?ah?n, Sami Eren
Pages : 191-198
Doi:10.17826/cumj.997873
View : 12 | Download : 2
Publication Date : 2022-03-31
Article Type : Research
Abstract :Amaç: Örneklerin mikroskopi ve kültür sonuçlarının karşılaştırılması, izolatların ilaç direnç oranlarının belirlenmesi, suşlar arasındaki epidemiyolojik ilişkilerin ERIC-PCR, RAPD-PCR, OUT-PCR ile ev içi PCR tekniğine dayalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: 2010 numunenin direkt mikroskopi ve kültür sonuçları analiz edildi. İlaç duyarlılık sonuçları TULSA'dan elde edildi. İzolatların tiplendirilmesi, bir devlet üniversitesinin tıp fakültesinin mikrobiyoloji laboratuvarında, in house PCR yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Pozitif örneklerin %2.68'inde Aside dirençli basil (ARB) pozitif + kültür pozitifliği, yaymada %2.93'ünde ARB pozitif ve kültür negatif, yaymada %1.34'ünde ARB negatif ve kültür pozitifliği vardı. Kültür pozitif olan 33 izolatta primer antitüberküloz (anti-TB) ilaçlara direnç görülmezken, bir veya daha fazla primer anti-TB ilaca direnç %9.09'da gözlendi. Tek ilaç direnci %3.03, Isoniazid (INH) ve INH kritik ilaçlara direnç %6.06 idi. İzolatlar ERIC-PCR ile 3 gruba, OUT-PCR için 5 grup ve RAPD-PCR ile 6 gruba ayrıldı. Sonuç: Çalışılan numune oranının düşük olması, tedavi sürecinde alınan numunelerin negatif olması nedeniyle pozitiflik oranları düşüktü. ERIC-PCR, RAPD-PCR ve OUT-PCR gibi moleküler teknikler, kökenler arasındaki farklılıkları, benzerlikleri değerlendirmede Mycobacterium tuberculosis'in (MTB) epidemiyolojik tiplendirilmesi için kolay, hızlı ve ucuz yöntemlerdir.Keywords : Mycobacterium tuberculosis, EZN, ERIC-PCR, RAPD-PCR, OUT-PCR