LMP-1 ve Nazofaringial Karsinoma
Authors : Anggun Indah Budiningrum, Achmad Rofi'i, Suharjono Suharjono, Fatchiyah Fatchiyah
Pages : 480-487
Doi:10.17826/cutf.53492
View : 14 | Download : 12
Publication Date : 2014-07-22
Article Type : Research
Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı nazofaringial karsinomun litik fazı üzerine etkili olduğu düşünülen LMP-1, ile H2O2 , nitrozamin ve nikotinin gibi dış faktörler arasındaki etkileşimi belirlemektir. Materyal ve Metod: insan LMP-1 (GI: 343177335) aminoasid sekansı ile nikotin (ID: 89594), nitrozamin (ID: 37183) ve H2O2 (ID: 37183) nin yapısal içeriği The National center of Biotechnology Information'a ait veri tabanına göre açıklanmıştır. LMP-1 in 3 boyutlu yapısı SWISS-MODEL web ağı kullanarak tasarlandı. Hex 6,12 hedef moleküle öncülük etmesi için kullanıldı. LigPlus+1.4.4 software ile ligand detayları tarandı. Moleküler grafikler ve analizler PyMOL ile yapıldı. Bulgular: LMP-1 in H2O2 , nitrozamin ve nikotin ile etkileşimi vardır. LMP-1 in H2O2 etkileşimi için harcadığı enerji (-67,79 kj/mol), nikotin (-149,43 kj/mol) ve nitrozamin (-82,93 kj/mol) için kullanılandan daha düşüktür. LMP-1 ile H2O2 arasındaki etkileşimin türü Hidrojen bağı iken LMP-1 ile nitrozamin ve nikotin arasındaki etkileşim hidrofobik bağdır. Sonuç: LMP-1 H2O2 ile nitrozamin ve nikotine göre daha güçlü bağ kurar. Dış etken olan H2O2 nin LMP-1 i etkileyerek NPC li hastalarda litik enfeksiyon fazına geçişe neden olduğu tahmin edilmektedir.Keywords : H2O2, LMP-1, nazofaringial karsinom, nikotin, nitrozamin.