- Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dergisi
- Vol: 47 Issue: 1
- EVALUATION OF ZERUMBONE AS AN EGFR TYROSINE KINASE INHIBITOR BY MOLECULAR DOCKING METHOD
EVALUATION OF ZERUMBONE AS AN EGFR TYROSINE KINASE INHIBITOR BY MOLECULAR DOCKING METHOD
Authors : Dilek Yonar, Burcu Baba, Arzu Karayel
Pages : 196-207
Doi:10.33483/jfpau.1172166
View : 11 | Download : 4
Publication Date : 2023-01-20
Article Type : Research
Abstract :Amaç: EGFR-TK bölgesi, başta akciğer kanseri olmak üzere çeşitli kanser türlerinin başlaması ve ilerlemesinde büyük önem taşımaktadır. Mevcut EGFR-TK inhibitörlerinin çeşitli yan etkilerinin varlığı, onların uygun kanser terapötikleri olarak kullanılmalarını sınırlandırmaktadır. Bu çalışmada, moleküler yerleştirme yaklaşımı ile EGFR\'yi hedef alan bir antikanser ajan olarak zerumbonun aktivitesini analiz etmeyi ve aktivitesini kurkumin ile karşılaştırmalı olarak değerlendirmeyi amaçladık. Gereç ve Yöntem: EGFR\'nin zerumbon ve kurkumin ile bağlanmasını etkileyen elektrostatik etkileşimleri değerlendirmek için B3LYP/6-31G(D,P) seviyesinde MEP ve HOMO-LUMO analizleri yapıldı. Bağlanma enerjileri moleküler yerleştirme ile belirlendi ve referans ligand olarak erlotinib ile karşılaştırıldı. Sonuç ve Tartışma: Yerleştirme çalışmaları, erlotinib (-7.3 kcal/mol) ile karşılaştırıldığında, sırasıyla -8.0 ve -7.6 kcal/mol bağlanma enerjileriyle kurkumin ve zerumbon için daha yüksek bağlanmalar (düşük bağlanma enerjisi) gösterdi. Ancak aralarında önemli bir fark gözlenmedi. Zerumbonun ΔE enerji aralığı 5.09 eV olarak bulundu. Bu sonuç, bu bileşiğin kurkumin (ΔE=3.68 eV) ve erlotinib ile karşılaştırıldığında (ΔE=4.29 eV) daha fazla kararlılığa sahip olduğu anlamına gelmektedir. Ayrıca, zerumbon EGFR ile güçlü hidrojen bağı etkileşimleri gösterdi ve bu da onun hem kurkumin hem de erlotinib\'deki gibi EGFR inhibitörü olarak potansiyeli olduğunu göstermiştir. Zerumbonun EGFR-TK\'ye karşı inhibitör aktiviteye sahip olabileceği sonucuna varıldı.Keywords : Akciğer kanseri, epidermal büyüme faktörü reseptörü, kurkumin, moleküler yerleştirme, zerumbon