- Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dergisi
- Vol: 38 Issue: 3
- DOCKING STUDIES OF SOME RETINOIDAL COMPOUNDS TO RXRα PROTEIN
DOCKING STUDIES OF SOME RETINOIDAL COMPOUNDS TO RXRα PROTEIN
Authors : A. Selen Gurkan-alp, Erdem Buyukbingol
Pages : 155-166
Doi:10.1501/Eczfak_0000000524
View : 14 | Download : 6
Publication Date : 2009-09-01
Article Type : Research
Abstract :Retinoid türevleri ve RXR-alfa (RXRα) reseptör proteini arasındaki etkileşimleri incelemek için AutoDock Tools - 1.5.4 kullanılarak, önceki çalışmada sentezi gerçekleştirilen retinoid analoglarının doking çalışmaları yapılmıştır. RXRα reseptör proteini, Protein Veri Bankasından *.pdb formatında (3FUG) alınmıştır. Bileşiklerin farklı konformasyonlardaki etkileşiminin bağlanma enerjileri elde edilmiş ve her bir bileşiği temsilen en iyi uyumu veren konformasyon seçilmiştir. Bileşik 17, RXRα proteinine en güçlü bağlanan bileşik (∆G = -10.90 kcal/mol) olarak ortaya çıkmaktadırKeywords : AutoDock Tools, Doking, Retinoid, RXR-α