- Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi
- Vol: 7 Issue: 3
- Genetic variability of Grapevine Leafroll-Associated Virus-1,2,3,4 Infecting Vineyards in Tokat Prov...
Genetic variability of Grapevine Leafroll-Associated Virus-1,2,3,4 Infecting Vineyards in Tokat Province of Turkey
Authors : Kübra Saritaş, Şerife Topkaya
Pages : 438-446
Doi:10.24180/ijaws.977439
View : 6 | Download : 3
Publication Date : 2021-12-30
Article Type : Research
Abstract :Asma yaprak kıvırcıklığı hastalığı (GLRD), dünya çapında asmanın en önemli viral hastalıklarından biridir. Bu çalışma, Grapevine leafroll associated virus -1 (GLRaV-1), Grapevine leafroll associated virus -2 (GLRaV-2), Grapevine leafroll associated virus -3 (GLRaV-3), Grapevine leafroll-associated virus 4 (GLRaV-4), ve Grapevine leafroll-associated virus-9 (GLRaV-9) etmenlerinin yaygınlığının araştırılması amacıyla yapılmıştır. Bunun için Tokat ili Merkez, Erbaa, Niksar ve Pazar ilçelerindeki farklı bağ alanlarından virüs benzeri belirti gösteren asmalardan yaprak örnekleri ve bir yıllık bitki sürgünleri toplanmıştır. Surveyde elde edilen toplam 197 örnek GLRaV-1, GLRaV-2, GLRaV-3, GLRaV-4) ve GLRaV-9 etmenlerine özgü primerler ile iki aşamalı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak moleküler olarak test edilmiştir. 197 örnekten 106'sı (%53.80) bu virüslerle tekli veya çoklu enfeksiyon tespit edilmiştir. 103 (%52,28) örnek GLRaV-1 ile pozitif sonuçlanırken, enfeksiyon oranları 10 örnekle GLRaV-3 için %5,18, GLRaV-4 için 5 örnekle %2,53, GLRaV-2 ve GLRaV-9 için %1,03 olarak belirlenmiştir. GLRaV-1, GLRaV-2 ve GLRaV-3'ün pozitif PCR ürünleri çift yönlü sekans analizinden sonra MEGAX ile GenBank'taki referans diğer izolatlarla karşılaştırılması yapılmıştır. GLRaV-1 izolatlarının sekans analizine göre GenBank'taki referans izolatlarla %94-96, GLRaV-2 izolatları %96-99 ve GLRaV-3'ün UO3-3 izolatı %99-100 nükleotid benzerliği göstermiştir.Keywords : Vitis vinifera, virus, RT-PCR, Tokat, Asma yaprak kıvırcıklığı hastalığı