- Türkiye Entomoloji Dergisi
- Vol: 46 Issue: 1
- Biochemical and molecular identification of root-knot nematodes in greenhouse vegetable areas of Eas...
Biochemical and molecular identification of root-knot nematodes in greenhouse vegetable areas of Eastern Mediterranean Region (Turkey)
Authors : Ayşenur ASLAN, İbrahim Halil ELEKCİOĞLU
Pages : 115-127
Doi:10.16970/entoted.1055181
View : 19 | Download : 4
Publication Date : 2022-03-01
Article Type : Research
Abstract :Kök ur nematodu sürvey çalışmaları Doğu Akdeniz Bölgesi (Türkiye)’nde bulunan Mersin, Hatay ve Adana illerinde yoğun olarak sebze üretimi yapılan sera alanlarını kapsayacak şekilde 2017 ve 2018 yılı üretim sezonu boyunca yapılmıştır. Biyokimyasal ve moleküler tanılama teknikleri kullanılarak toplam 46 kök-ur nematodu popülasyonu karakterize edilmiştir. DNA ekstraksiyonu ikinci dönem larvalardan yapılmış olup, SCAR primerleri kullanılarak yapılan moleküler analizde Meloidogyne arenaria (Neal, 1889) Chitwood, 1949, Meloidogyne javanica (Treub) Chitwood, 1949, Meloidogyne incognita (Kofoid & White, 1919) Chitwood, 1949, Meloidogyne hapla Chitwood, 1949 ve Meloidogyne ethiopica Whitehead, 1968 (Nematoda: Heteroderidae) türleri taranmıştır. Sonuçlar incelendiğinde, otuz dokuz bölgeden elde edilen örnekler M. incognita (%85) olarak, yedi örnek ise M. javanica (%15) olarak tespit edilmiştir. Ek olarak, polyacrylamide jel elektroforez tanılama yöntemi kullanılarak tüm bölgelerden elde edilen genç dişi bireyler biyokimyasal olarak analiz edilmiştir. Meloidogyne incognita , M. javanica ve M. ethiopica grubu tanılamak için esteraz enzim profiline bakılmıştır. Meloidogyne incognita popülasyonlarında %62 oranında esteraz fenotip I1 bandı, %39 oranında ise esteraz fenotip I2 bandı gözlenmiştir. Bütün M. javanica popülasyonlarında esteraz fenotip J3 bandı tespit edilmiştir. Meloidogyne javanica ve M. incognita , Doğu Akdeniz Bölgesi’nde moleküler ve biyokimyasal yöntemlerle tanılanmış olup, bu iki yöntemden elde edilen sonuçlar birbirini desteklemektedir.Keywords : Meloidogyne, PAGE, PCR, kök-ur nematodları, sebze