- Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi
- Vol: 19 Issue: 2
- Evaluation of Variation on Myostatin (MSTN) Gene of Turkish Donkey Populations in Thrace Region of T...
Evaluation of Variation on Myostatin (MSTN) Gene of Turkish Donkey Populations in Thrace Region of Turkey
Authors : Raziye Işik, Fulya Özdil, Sena Meral
Pages : 426-434
Doi:10.33462/jotaf.1015587
View : 10 | Download : 2
Publication Date : 2022-05-31
Article Type : Research
Abstract :Çalışma, Türkiye’de Trakya bölgesinde yetiştirilen 90 eşekte MSTN genindeki varyasyonunu belirlemeyi amaçlamıştır. GDF-8 (growth differentiation factor 8) olarak da adlandırılan miyostatin (MSTN), farklılaşma büyüme faktörü β (TGF-β) süper ailesinin bir parçasıdır ve memeli türlerinde kas kütlesi, büyüme ve gelişme üzerinde negatif düzenleyici rolü bulunmaktadır. MSTN geni, iskelet kası büyümesini olumsuz yönde düzenler ve iskelet kaslarının homeostazında önemli bir role sahiptir. Ayrıca, kas liflerinde protein dengesi Myostatin faktörü tarafından desteklenmektedir. MSTN geninin toplam 866 bç uzunluğunda kısmi intron 1, 2 ve ekzon 2 bölgeleri çoğaltılmış ve PCR ürünleri DNA dizilimi kullanılarak analiz edilmiştir. Bu çalışmada MSTN geninin ikinci ekzon bölgesinde proteinde amino asit değişikliğine neden olmayan yeni bir sinonim SNP g.4183919 G>A belirlenmiştir. G>A değişimi, lösin amino asidinde sessiz bir mutasyona neden olmuştur. Sinonim mutasyonlar nedeniyle mRNA düzeyinde ve proteinin işlevselliğinde değişiklikler meydana gelebilmektedir. Lösin, kas kütlesi kaybını önleyebilen ve miyostatin ekspresyonunu engelleyen önemli bir amino asit olduğundan, bu çalışmada eşeklerde Leu'nun sessiz mutasyonunun eşeklerin kas kütlesini ve fiziksel yapısını değiştirebileceği söylenebilir. Mutant lösin, kas kaybını önlemede daha düşük bir etkiye sahip olduğundan, daha fazla Myostatin protein ekspresyonuna neden olabilmektedir. Türk eşeklerinde daha önce atlarda bulunan bu mutasyonlar tespit edilememiştir, bu da eşeklerin yarış kabiliyeti için daha az gereksinime sahip olduklarını göstermektedir. Tespit edilen SNP ilk olarak ortaya konmuş ve mevcut çalışma ile Türk eşeklerinde MSTN geninin DNA dizileri ilk kez ortaya çıkartılmıştır. MSTN geninin dizileri, MW970078-MW970079 erişim numarasıyla NCBI GenBank'a girilmiştir. Eşek ırklarında MSTN genindeki SNP'lerin ve bunların ekonomik öneme sahip morfolojik karakterlerle ilişkisinin protein ve moleküler düzeyde belirlenmesi amacıyla daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır.Keywords : MSTN, Eşek, Trakya, SNP, Sekanslama